Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z139

Ror1, Inactive tyrosine-protein kinase transmembrane receptor ROR1, mousemouse

Predictions only

Length 937 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ror1Q9Z139 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ror1Q9Z139 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ror1Q9Z139 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ror1Q9Z139 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ror1Q9Z139 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Ror1Q9Z139 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ror1Q9Z139 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ror1Q9Z139 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ror1Q9Z139 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ror1Q9Z139 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ror1Q9Z139 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ror1Q9Z139 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Ror1Q9Z139 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ror1Q9Z139 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ror1Q9Z139 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ror1Q9Z139 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ror1Q9Z139 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ror1Q9Z139 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ror1Q9Z139 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ror1Q9Z139 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ror1Q9Z139 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ror1Q9Z139 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ror1Q9Z139 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ror1Q9Z139 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ror1Q9Z139 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Ror1Q9Z139 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ror1Q9Z139 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ror1Q9Z139 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ror1Q9Z139 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ror1Q9Z139 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ror1Q9Z139 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ror1Q9Z139 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ror1Q9Z139 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ror1Q9Z139 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ror1Q9Z139 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ror1Q9Z139 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ror1Q9Z139 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ror1Q9Z139 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ror1Q9Z139 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ror1Q9Z139 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ror1Q9Z139 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ror1Q9Z139 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ror1Q9Z139 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ror1Q9Z139 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ror1Q9Z139 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Ror1Q9Z139 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ror1Q9Z139 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ror1Q9Z139 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ror1Q9Z139 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ror1Q9Z139 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ror1Q9Z139 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ror1Q9Z139 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ror1Q9Z139 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ror1Q9Z139 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ror1Q9Z139 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ror1Q9Z139 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ror1Q9Z139 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ror1Q9Z139 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ror1Q9Z139 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ror1Q9Z139 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ror1Q9Z139 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ror1Q9Z139 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ror1Q9Z139 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ror1Q9Z139 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ror1Q9Z139 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ror1Q9Z139 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ror1Q9Z139 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ror1Q9Z139 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ror1Q9Z139 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ror1Q9Z139 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ror1Q9Z139 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ror1Q9Z139 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ror1Q9Z139 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ror1Q9Z139 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ror1Q9Z139 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ror1Q9Z139 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ror1Q9Z139 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ror1Q9Z139 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ror1Q9Z139 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ror1Q9Z139 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ror1Q9Z139 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ror1Q9Z139 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Ror1Q9Z139 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ror1Q9Z139 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Ror1Q9Z139 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ror1Q9Z139 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ror1Q9Z139 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ror1Q9Z139 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ror1Q9Z139 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ror1Q9Z139 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Ror1Q9Z139 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Ror1Q9Z139 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ror1Q9Z139 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ror1Q9Z139 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ror1Q9Z139 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ror1Q9Z139 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Ror1Q9Z139 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Ror1Q9Z139 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ror1Q9Z139 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ror1Q9Z139 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.4 ms