Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTU3

Scn8a, Sodium channel protein type 8 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,978 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn8aQ9WTU3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Scn8aQ9WTU3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Scn8aQ9WTU3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Scn8aQ9WTU3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Scn8aQ9WTU3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Scn8aQ9WTU3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Scn8aQ9WTU3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Scn8aQ9WTU3 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Scn8aQ9WTU3 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Scn8aQ9WTU3 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Scn8aQ9WTU3 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Scn8aQ9WTU3 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Scn8aQ9WTU3 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Scn8aQ9WTU3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Scn8aQ9WTU3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Scn8aQ9WTU3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Scn8aQ9WTU3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Scn8aQ9WTU3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Scn8aQ9WTU3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Scn8aQ9WTU3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Scn8aQ9WTU3 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Scn8aQ9WTU3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Scn8aQ9WTU3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Scn8aQ9WTU3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Scn8aQ9WTU3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Scn8aQ9WTU3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Scn8aQ9WTU3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Scn8aQ9WTU3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Scn8aQ9WTU3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Scn8aQ9WTU3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Scn8aQ9WTU3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Scn8aQ9WTU3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Scn8aQ9WTU3 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Scn8aQ9WTU3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Scn8aQ9WTU3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Scn8aQ9WTU3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Scn8aQ9WTU3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Scn8aQ9WTU3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Scn8aQ9WTU3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Scn8aQ9WTU3 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Scn8aQ9WTU3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Scn8aQ9WTU3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Scn8aQ9WTU3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Scn8aQ9WTU3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Scn8aQ9WTU3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Scn8aQ9WTU3 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Scn8aQ9WTU3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Scn8aQ9WTU3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Scn8aQ9WTU3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Scn8aQ9WTU3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Scn8aQ9WTU3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Scn8aQ9WTU3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Scn8aQ9WTU3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Scn8aQ9WTU3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Scn8aQ9WTU3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Scn8aQ9WTU3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Scn8aQ9WTU3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Scn8aQ9WTU3 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Scn8aQ9WTU3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Scn8aQ9WTU3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Scn8aQ9WTU3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Scn8aQ9WTU3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Scn8aQ9WTU3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Scn8aQ9WTU3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Scn8aQ9WTU3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Scn8aQ9WTU3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Scn8aQ9WTU3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Scn8aQ9WTU3 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Scn8aQ9WTU3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Scn8aQ9WTU3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Scn8aQ9WTU3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Scn8aQ9WTU3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Scn8aQ9WTU3 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Scn8aQ9WTU3 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Scn8aQ9WTU3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Scn8aQ9WTU3 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Scn8aQ9WTU3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Scn8aQ9WTU3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Scn8aQ9WTU3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Scn8aQ9WTU3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Scn8aQ9WTU3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Scn8aQ9WTU3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Scn8aQ9WTU3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Scn8aQ9WTU3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Scn8aQ9WTU3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Scn8aQ9WTU3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Scn8aQ9WTU3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Scn8aQ9WTU3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Scn8aQ9WTU3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Scn8aQ9WTU3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Scn8aQ9WTU3 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Scn8aQ9WTU3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Scn8aQ9WTU3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Scn8aQ9WTU3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Scn8aQ9WTU3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Scn8aQ9WTU3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Scn8aQ9WTU3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Scn8aQ9WTU3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Scn8aQ9WTU3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Scn8aQ9WTU3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.4 ms