Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1A8

Rfwd2, E3 ubiquitin-protein ligase RFWD2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfwd2Q9R1A8 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rfwd2Q9R1A8 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rfwd2Q9R1A8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rfwd2Q9R1A8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rfwd2Q9R1A8 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rfwd2Q9R1A8 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rfwd2Q9R1A8 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rfwd2Q9R1A8 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rfwd2Q9R1A8 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rfwd2Q9R1A8 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rfwd2Q9R1A8 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rfwd2Q9R1A8 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rfwd2Q9R1A8 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rfwd2Q9R1A8 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rfwd2Q9R1A8 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rfwd2Q9R1A8 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rfwd2Q9R1A8 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rfwd2Q9R1A8 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rfwd2Q9R1A8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rfwd2Q9R1A8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rfwd2Q9R1A8 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rfwd2Q9R1A8 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rfwd2Q9R1A8 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rfwd2Q9R1A8 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Rfwd2Q9R1A8 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Rfwd2Q9R1A8 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rfwd2Q9R1A8 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rfwd2Q9R1A8 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rfwd2Q9R1A8 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rfwd2Q9R1A8 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rfwd2Q9R1A8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rfwd2Q9R1A8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rfwd2Q9R1A8 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rfwd2Q9R1A8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rfwd2Q9R1A8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rfwd2Q9R1A8 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rfwd2Q9R1A8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rfwd2Q9R1A8 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rfwd2Q9R1A8 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rfwd2Q9R1A8 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rfwd2Q9R1A8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Rfwd2Q9R1A8 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rfwd2Q9R1A8 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rfwd2Q9R1A8 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rfwd2Q9R1A8 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rfwd2Q9R1A8 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rfwd2Q9R1A8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rfwd2Q9R1A8 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rfwd2Q9R1A8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rfwd2Q9R1A8 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rfwd2Q9R1A8 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rfwd2Q9R1A8 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rfwd2Q9R1A8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Rfwd2Q9R1A8 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rfwd2Q9R1A8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rfwd2Q9R1A8 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rfwd2Q9R1A8 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rfwd2Q9R1A8 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rfwd2Q9R1A8 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rfwd2Q9R1A8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rfwd2Q9R1A8 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rfwd2Q9R1A8 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Rfwd2Q9R1A8 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Rfwd2Q9R1A8 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rfwd2Q9R1A8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rfwd2Q9R1A8 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rfwd2Q9R1A8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rfwd2Q9R1A8 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rfwd2Q9R1A8 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rfwd2Q9R1A8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rfwd2Q9R1A8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rfwd2Q9R1A8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rfwd2Q9R1A8 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rfwd2Q9R1A8 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rfwd2Q9R1A8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rfwd2Q9R1A8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rfwd2Q9R1A8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rfwd2Q9R1A8 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rfwd2Q9R1A8 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rfwd2Q9R1A8 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rfwd2Q9R1A8 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rfwd2Q9R1A8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rfwd2Q9R1A8 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rfwd2Q9R1A8 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rfwd2Q9R1A8 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rfwd2Q9R1A8 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rfwd2Q9R1A8 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rfwd2Q9R1A8 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rfwd2Q9R1A8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rfwd2Q9R1A8 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rfwd2Q9R1A8 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Rfwd2Q9R1A8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rfwd2Q9R1A8 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rfwd2Q9R1A8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rfwd2Q9R1A8 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rfwd2Q9R1A8 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rfwd2Q9R1A8 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rfwd2Q9R1A8 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rfwd2Q9R1A8 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rfwd2Q9R1A8 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms