Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0A5

Nek3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek3Q9R0A5 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nek3Q9R0A5 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nek3Q9R0A5 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nek3Q9R0A5 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nek3Q9R0A5 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nek3Q9R0A5 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Nek3Q9R0A5 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nek3Q9R0A5 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nek3Q9R0A5 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nek3Q9R0A5 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nek3Q9R0A5 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nek3Q9R0A5 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nek3Q9R0A5 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nek3Q9R0A5 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nek3Q9R0A5 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nek3Q9R0A5 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nek3Q9R0A5 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nek3Q9R0A5 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nek3Q9R0A5 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nek3Q9R0A5 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nek3Q9R0A5 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nek3Q9R0A5 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nek3Q9R0A5 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nek3Q9R0A5 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nek3Q9R0A5 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nek3Q9R0A5 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nek3Q9R0A5 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nek3Q9R0A5 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nek3Q9R0A5 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Nek3Q9R0A5 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nek3Q9R0A5 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nek3Q9R0A5 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Nek3Q9R0A5 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nek3Q9R0A5 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nek3Q9R0A5 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Nek3Q9R0A5 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nek3Q9R0A5 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nek3Q9R0A5 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nek3Q9R0A5 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nek3Q9R0A5 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nek3Q9R0A5 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nek3Q9R0A5 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nek3Q9R0A5 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nek3Q9R0A5 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nek3Q9R0A5 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nek3Q9R0A5 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nek3Q9R0A5 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nek3Q9R0A5 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nek3Q9R0A5 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Nek3Q9R0A5 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Nek3Q9R0A5 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Nek3Q9R0A5 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nek3Q9R0A5 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nek3Q9R0A5 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nek3Q9R0A5 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nek3Q9R0A5 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nek3Q9R0A5 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nek3Q9R0A5 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nek3Q9R0A5 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nek3Q9R0A5 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nek3Q9R0A5 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nek3Q9R0A5 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nek3Q9R0A5 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nek3Q9R0A5 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nek3Q9R0A5 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nek3Q9R0A5 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nek3Q9R0A5 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nek3Q9R0A5 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nek3Q9R0A5 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Nek3Q9R0A5 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nek3Q9R0A5 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nek3Q9R0A5 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nek3Q9R0A5 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nek3Q9R0A5 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nek3Q9R0A5 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nek3Q9R0A5 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nek3Q9R0A5 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nek3Q9R0A5 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Nek3Q9R0A5 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Nek3Q9R0A5 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Nek3Q9R0A5 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Nek3Q9R0A5 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Nek3Q9R0A5 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nek3Q9R0A5 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nek3Q9R0A5 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nek3Q9R0A5 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nek3Q9R0A5 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nek3Q9R0A5 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nek3Q9R0A5 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nek3Q9R0A5 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nek3Q9R0A5 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nek3Q9R0A5 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nek3Q9R0A5 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nek3Q9R0A5 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nek3Q9R0A5 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nek3Q9R0A5 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Nek3Q9R0A5 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nek3Q9R0A5 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nek3Q9R0A5 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nek3Q9R0A5 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms