Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXW9

Slc7a8, Large neutral amino acids transporter small subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc7a8Q9QXW9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc7a8Q9QXW9 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc7a8Q9QXW9 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc7a8Q9QXW9 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc7a8Q9QXW9 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc7a8Q9QXW9 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc7a8Q9QXW9 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc7a8Q9QXW9 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc7a8Q9QXW9 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc7a8Q9QXW9 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc7a8Q9QXW9 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc7a8Q9QXW9 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc7a8Q9QXW9 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc7a8Q9QXW9 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc7a8Q9QXW9 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc7a8Q9QXW9 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc7a8Q9QXW9 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc7a8Q9QXW9 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc7a8Q9QXW9 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc7a8Q9QXW9 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc7a8Q9QXW9 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc7a8Q9QXW9 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc7a8Q9QXW9 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc7a8Q9QXW9 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc7a8Q9QXW9 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc7a8Q9QXW9 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc7a8Q9QXW9 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc7a8Q9QXW9 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Slc7a8Q9QXW9 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc7a8Q9QXW9 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc7a8Q9QXW9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc7a8Q9QXW9 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Slc7a8Q9QXW9 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc7a8Q9QXW9 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc7a8Q9QXW9 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc7a8Q9QXW9 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc7a8Q9QXW9 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc7a8Q9QXW9 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc7a8Q9QXW9 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc7a8Q9QXW9 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc7a8Q9QXW9 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Slc7a8Q9QXW9 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Slc7a8Q9QXW9 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc7a8Q9QXW9 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.3■■□□□ 1
Slc7a8Q9QXW9 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc7a8Q9QXW9 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc7a8Q9QXW9 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Slc7a8Q9QXW9 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Slc7a8Q9QXW9 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc7a8Q9QXW9 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc7a8Q9QXW9 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Slc7a8Q9QXW9 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc7a8Q9QXW9 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc7a8Q9QXW9 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc7a8Q9QXW9 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc7a8Q9QXW9 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slc7a8Q9QXW9 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slc7a8Q9QXW9 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Slc7a8Q9QXW9 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slc7a8Q9QXW9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slc7a8Q9QXW9 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slc7a8Q9QXW9 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc7a8Q9QXW9 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc7a8Q9QXW9 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc7a8Q9QXW9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc7a8Q9QXW9 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc7a8Q9QXW9 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc7a8Q9QXW9 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc7a8Q9QXW9 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc7a8Q9QXW9 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc7a8Q9QXW9 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc7a8Q9QXW9 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc7a8Q9QXW9 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc7a8Q9QXW9 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc7a8Q9QXW9 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc7a8Q9QXW9 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc7a8Q9QXW9 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc7a8Q9QXW9 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc7a8Q9QXW9 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc7a8Q9QXW9 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc7a8Q9QXW9 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc7a8Q9QXW9 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc7a8Q9QXW9 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc7a8Q9QXW9 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc7a8Q9QXW9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc7a8Q9QXW9 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc7a8Q9QXW9 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc7a8Q9QXW9 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc7a8Q9QXW9 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc7a8Q9QXW9 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Slc7a8Q9QXW9 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc7a8Q9QXW9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc7a8Q9QXW9 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc7a8Q9QXW9 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc7a8Q9QXW9 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc7a8Q9QXW9 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc7a8Q9QXW9 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc7a8Q9QXW9 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc7a8Q9QXW9 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Slc7a8Q9QXW9 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms