Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT8

Kcnip3, Calsenilin, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip3Q9QXT8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kcnip3Q9QXT8 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kcnip3Q9QXT8 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kcnip3Q9QXT8 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Kcnip3Q9QXT8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kcnip3Q9QXT8 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kcnip3Q9QXT8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kcnip3Q9QXT8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kcnip3Q9QXT8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kcnip3Q9QXT8 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kcnip3Q9QXT8 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kcnip3Q9QXT8 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kcnip3Q9QXT8 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kcnip3Q9QXT8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kcnip3Q9QXT8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kcnip3Q9QXT8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kcnip3Q9QXT8 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kcnip3Q9QXT8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kcnip3Q9QXT8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kcnip3Q9QXT8 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Kcnip3Q9QXT8 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kcnip3Q9QXT8 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kcnip3Q9QXT8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kcnip3Q9QXT8 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kcnip3Q9QXT8 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kcnip3Q9QXT8 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kcnip3Q9QXT8 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kcnip3Q9QXT8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kcnip3Q9QXT8 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kcnip3Q9QXT8 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kcnip3Q9QXT8 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kcnip3Q9QXT8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kcnip3Q9QXT8 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kcnip3Q9QXT8 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kcnip3Q9QXT8 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kcnip3Q9QXT8 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kcnip3Q9QXT8 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kcnip3Q9QXT8 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kcnip3Q9QXT8 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kcnip3Q9QXT8 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kcnip3Q9QXT8 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Kcnip3Q9QXT8 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Kcnip3Q9QXT8 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Kcnip3Q9QXT8 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Kcnip3Q9QXT8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Kcnip3Q9QXT8 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Kcnip3Q9QXT8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Kcnip3Q9QXT8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Kcnip3Q9QXT8 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Kcnip3Q9QXT8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Kcnip3Q9QXT8 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Kcnip3Q9QXT8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Kcnip3Q9QXT8 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Kcnip3Q9QXT8 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Kcnip3Q9QXT8 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Kcnip3Q9QXT8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Kcnip3Q9QXT8 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Kcnip3Q9QXT8 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Kcnip3Q9QXT8 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Kcnip3Q9QXT8 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Kcnip3Q9QXT8 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Kcnip3Q9QXT8 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Kcnip3Q9QXT8 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Kcnip3Q9QXT8 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Kcnip3Q9QXT8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Kcnip3Q9QXT8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Kcnip3Q9QXT8 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Kcnip3Q9QXT8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Kcnip3Q9QXT8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Kcnip3Q9QXT8 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Kcnip3Q9QXT8 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Kcnip3Q9QXT8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Kcnip3Q9QXT8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kcnip3Q9QXT8 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kcnip3Q9QXT8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kcnip3Q9QXT8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kcnip3Q9QXT8 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kcnip3Q9QXT8 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kcnip3Q9QXT8 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kcnip3Q9QXT8 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kcnip3Q9QXT8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kcnip3Q9QXT8 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kcnip3Q9QXT8 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kcnip3Q9QXT8 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kcnip3Q9QXT8 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kcnip3Q9QXT8 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kcnip3Q9QXT8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Kcnip3Q9QXT8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Kcnip3Q9QXT8 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Kcnip3Q9QXT8 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kcnip3Q9QXT8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kcnip3Q9QXT8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Kcnip3Q9QXT8 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kcnip3Q9QXT8 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kcnip3Q9QXT8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kcnip3Q9QXT8 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kcnip3Q9QXT8 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kcnip3Q9QXT8 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kcnip3Q9QXT8 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kcnip3Q9QXT8 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms