Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXE0

Hacl1, 2-hydroxyacyl-CoA lyase 1, mousemouse

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacl1Q9QXE0 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Hacl1Q9QXE0 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hacl1Q9QXE0 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hacl1Q9QXE0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hacl1Q9QXE0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hacl1Q9QXE0 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hacl1Q9QXE0 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hacl1Q9QXE0 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hacl1Q9QXE0 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hacl1Q9QXE0 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hacl1Q9QXE0 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hacl1Q9QXE0 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Hacl1Q9QXE0 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hacl1Q9QXE0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hacl1Q9QXE0 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hacl1Q9QXE0 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hacl1Q9QXE0 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hacl1Q9QXE0 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hacl1Q9QXE0 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hacl1Q9QXE0 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hacl1Q9QXE0 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hacl1Q9QXE0 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hacl1Q9QXE0 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Hacl1Q9QXE0 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hacl1Q9QXE0 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hacl1Q9QXE0 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hacl1Q9QXE0 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hacl1Q9QXE0 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hacl1Q9QXE0 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hacl1Q9QXE0 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hacl1Q9QXE0 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Hacl1Q9QXE0 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hacl1Q9QXE0 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hacl1Q9QXE0 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hacl1Q9QXE0 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hacl1Q9QXE0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hacl1Q9QXE0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hacl1Q9QXE0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hacl1Q9QXE0 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hacl1Q9QXE0 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hacl1Q9QXE0 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hacl1Q9QXE0 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hacl1Q9QXE0 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hacl1Q9QXE0 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hacl1Q9QXE0 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Hacl1Q9QXE0 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hacl1Q9QXE0 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hacl1Q9QXE0 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hacl1Q9QXE0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Hacl1Q9QXE0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hacl1Q9QXE0 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hacl1Q9QXE0 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hacl1Q9QXE0 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hacl1Q9QXE0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hacl1Q9QXE0 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hacl1Q9QXE0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hacl1Q9QXE0 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hacl1Q9QXE0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hacl1Q9QXE0 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hacl1Q9QXE0 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hacl1Q9QXE0 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hacl1Q9QXE0 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hacl1Q9QXE0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hacl1Q9QXE0 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hacl1Q9QXE0 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hacl1Q9QXE0 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hacl1Q9QXE0 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hacl1Q9QXE0 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hacl1Q9QXE0 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hacl1Q9QXE0 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hacl1Q9QXE0 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hacl1Q9QXE0 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hacl1Q9QXE0 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hacl1Q9QXE0 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hacl1Q9QXE0 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hacl1Q9QXE0 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hacl1Q9QXE0 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hacl1Q9QXE0 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hacl1Q9QXE0 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hacl1Q9QXE0 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hacl1Q9QXE0 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hacl1Q9QXE0 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hacl1Q9QXE0 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hacl1Q9QXE0 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hacl1Q9QXE0 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hacl1Q9QXE0 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hacl1Q9QXE0 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hacl1Q9QXE0 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hacl1Q9QXE0 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hacl1Q9QXE0 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hacl1Q9QXE0 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hacl1Q9QXE0 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hacl1Q9QXE0 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hacl1Q9QXE0 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hacl1Q9QXE0 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hacl1Q9QXE0 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hacl1Q9QXE0 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hacl1Q9QXE0 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hacl1Q9QXE0 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hacl1Q9QXE0 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.2 ms