Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWH1

Phc2, Polyhomeotic-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 850 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phc2Q9QWH1 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Phc2Q9QWH1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Phc2Q9QWH1 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Phc2Q9QWH1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Phc2Q9QWH1 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Phc2Q9QWH1 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Phc2Q9QWH1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Phc2Q9QWH1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Phc2Q9QWH1 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Phc2Q9QWH1 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Phc2Q9QWH1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Phc2Q9QWH1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Phc2Q9QWH1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Phc2Q9QWH1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Phc2Q9QWH1 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Phc2Q9QWH1 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Phc2Q9QWH1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Phc2Q9QWH1 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Phc2Q9QWH1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Phc2Q9QWH1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Phc2Q9QWH1 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Phc2Q9QWH1 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Phc2Q9QWH1 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Phc2Q9QWH1 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Phc2Q9QWH1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Phc2Q9QWH1 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Phc2Q9QWH1 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Phc2Q9QWH1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Phc2Q9QWH1 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Phc2Q9QWH1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Phc2Q9QWH1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Phc2Q9QWH1 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Phc2Q9QWH1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Phc2Q9QWH1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Phc2Q9QWH1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Phc2Q9QWH1 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Phc2Q9QWH1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Phc2Q9QWH1 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Phc2Q9QWH1 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Phc2Q9QWH1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Phc2Q9QWH1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Phc2Q9QWH1 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Phc2Q9QWH1 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Phc2Q9QWH1 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Phc2Q9QWH1 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Phc2Q9QWH1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Phc2Q9QWH1 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Phc2Q9QWH1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Phc2Q9QWH1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Phc2Q9QWH1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Phc2Q9QWH1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Phc2Q9QWH1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Phc2Q9QWH1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Phc2Q9QWH1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Phc2Q9QWH1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Phc2Q9QWH1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Phc2Q9QWH1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Phc2Q9QWH1 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Phc2Q9QWH1 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Phc2Q9QWH1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Phc2Q9QWH1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Phc2Q9QWH1 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Phc2Q9QWH1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Phc2Q9QWH1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Phc2Q9QWH1 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Phc2Q9QWH1 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Phc2Q9QWH1 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Phc2Q9QWH1 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Phc2Q9QWH1 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Phc2Q9QWH1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Phc2Q9QWH1 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Phc2Q9QWH1 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Phc2Q9QWH1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Phc2Q9QWH1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Phc2Q9QWH1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Phc2Q9QWH1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Phc2Q9QWH1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Phc2Q9QWH1 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Phc2Q9QWH1 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Phc2Q9QWH1 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Phc2Q9QWH1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Phc2Q9QWH1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Phc2Q9QWH1 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Phc2Q9QWH1 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Phc2Q9QWH1 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Phc2Q9QWH1 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Phc2Q9QWH1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Phc2Q9QWH1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Phc2Q9QWH1 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Phc2Q9QWH1 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Phc2Q9QWH1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Phc2Q9QWH1 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Phc2Q9QWH1 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Phc2Q9QWH1 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Phc2Q9QWH1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Phc2Q9QWH1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Phc2Q9QWH1 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Phc2Q9QWH1 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Phc2Q9QWH1 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Phc2Q9QWH1 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms