Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLV6

Pnkp, Bifunctional polynucleotide phosphatase/kinase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PnkpQ9JLV6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PnkpQ9JLV6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PnkpQ9JLV6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PnkpQ9JLV6 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PnkpQ9JLV6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PnkpQ9JLV6 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PnkpQ9JLV6 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PnkpQ9JLV6 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PnkpQ9JLV6 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PnkpQ9JLV6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PnkpQ9JLV6 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PnkpQ9JLV6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PnkpQ9JLV6 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PnkpQ9JLV6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PnkpQ9JLV6 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PnkpQ9JLV6 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PnkpQ9JLV6 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PnkpQ9JLV6 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PnkpQ9JLV6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PnkpQ9JLV6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PnkpQ9JLV6 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PnkpQ9JLV6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PnkpQ9JLV6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PnkpQ9JLV6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PnkpQ9JLV6 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PnkpQ9JLV6 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PnkpQ9JLV6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PnkpQ9JLV6 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PnkpQ9JLV6 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PnkpQ9JLV6 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PnkpQ9JLV6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PnkpQ9JLV6 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PnkpQ9JLV6 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PnkpQ9JLV6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PnkpQ9JLV6 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PnkpQ9JLV6 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PnkpQ9JLV6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PnkpQ9JLV6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PnkpQ9JLV6 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PnkpQ9JLV6 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PnkpQ9JLV6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PnkpQ9JLV6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PnkpQ9JLV6 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PnkpQ9JLV6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PnkpQ9JLV6 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PnkpQ9JLV6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PnkpQ9JLV6 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PnkpQ9JLV6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PnkpQ9JLV6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PnkpQ9JLV6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PnkpQ9JLV6 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PnkpQ9JLV6 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PnkpQ9JLV6 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PnkpQ9JLV6 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PnkpQ9JLV6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PnkpQ9JLV6 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PnkpQ9JLV6 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PnkpQ9JLV6 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PnkpQ9JLV6 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PnkpQ9JLV6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PnkpQ9JLV6 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PnkpQ9JLV6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PnkpQ9JLV6 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PnkpQ9JLV6 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PnkpQ9JLV6 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PnkpQ9JLV6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PnkpQ9JLV6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PnkpQ9JLV6 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PnkpQ9JLV6 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PnkpQ9JLV6 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PnkpQ9JLV6 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PnkpQ9JLV6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PnkpQ9JLV6 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PnkpQ9JLV6 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PnkpQ9JLV6 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PnkpQ9JLV6 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PnkpQ9JLV6 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PnkpQ9JLV6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PnkpQ9JLV6 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PnkpQ9JLV6 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PnkpQ9JLV6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PnkpQ9JLV6 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PnkpQ9JLV6 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PnkpQ9JLV6 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PnkpQ9JLV6 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PnkpQ9JLV6 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PnkpQ9JLV6 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PnkpQ9JLV6 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PnkpQ9JLV6 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PnkpQ9JLV6 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PnkpQ9JLV6 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PnkpQ9JLV6 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PnkpQ9JLV6 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PnkpQ9JLV6 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PnkpQ9JLV6 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PnkpQ9JLV6 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PnkpQ9JLV6 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PnkpQ9JLV6 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PnkpQ9JLV6 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PnkpQ9JLV6 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms