Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLJ0

Litaf, Lipopolysaccharide-induced tumor necrosis factor-alpha factor homolog, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LitafQ9JLJ0 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LitafQ9JLJ0 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LitafQ9JLJ0 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LitafQ9JLJ0 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LitafQ9JLJ0 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LitafQ9JLJ0 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LitafQ9JLJ0 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LitafQ9JLJ0 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
LitafQ9JLJ0 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LitafQ9JLJ0 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LitafQ9JLJ0 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LitafQ9JLJ0 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LitafQ9JLJ0 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LitafQ9JLJ0 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LitafQ9JLJ0 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LitafQ9JLJ0 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LitafQ9JLJ0 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LitafQ9JLJ0 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LitafQ9JLJ0 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LitafQ9JLJ0 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LitafQ9JLJ0 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LitafQ9JLJ0 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LitafQ9JLJ0 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LitafQ9JLJ0 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LitafQ9JLJ0 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LitafQ9JLJ0 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LitafQ9JLJ0 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
LitafQ9JLJ0 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LitafQ9JLJ0 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LitafQ9JLJ0 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LitafQ9JLJ0 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LitafQ9JLJ0 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LitafQ9JLJ0 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LitafQ9JLJ0 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LitafQ9JLJ0 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LitafQ9JLJ0 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LitafQ9JLJ0 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LitafQ9JLJ0 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LitafQ9JLJ0 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LitafQ9JLJ0 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LitafQ9JLJ0 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LitafQ9JLJ0 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LitafQ9JLJ0 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LitafQ9JLJ0 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LitafQ9JLJ0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LitafQ9JLJ0 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LitafQ9JLJ0 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LitafQ9JLJ0 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LitafQ9JLJ0 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LitafQ9JLJ0 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LitafQ9JLJ0 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LitafQ9JLJ0 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LitafQ9JLJ0 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LitafQ9JLJ0 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LitafQ9JLJ0 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LitafQ9JLJ0 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LitafQ9JLJ0 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LitafQ9JLJ0 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LitafQ9JLJ0 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LitafQ9JLJ0 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LitafQ9JLJ0 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
LitafQ9JLJ0 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
LitafQ9JLJ0 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
LitafQ9JLJ0 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LitafQ9JLJ0 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LitafQ9JLJ0 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LitafQ9JLJ0 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LitafQ9JLJ0 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LitafQ9JLJ0 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
LitafQ9JLJ0 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
LitafQ9JLJ0 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LitafQ9JLJ0 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LitafQ9JLJ0 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LitafQ9JLJ0 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LitafQ9JLJ0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LitafQ9JLJ0 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LitafQ9JLJ0 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LitafQ9JLJ0 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LitafQ9JLJ0 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LitafQ9JLJ0 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LitafQ9JLJ0 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LitafQ9JLJ0 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LitafQ9JLJ0 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LitafQ9JLJ0 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LitafQ9JLJ0 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LitafQ9JLJ0 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LitafQ9JLJ0 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LitafQ9JLJ0 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LitafQ9JLJ0 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LitafQ9JLJ0 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LitafQ9JLJ0 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LitafQ9JLJ0 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LitafQ9JLJ0 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LitafQ9JLJ0 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
LitafQ9JLJ0 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LitafQ9JLJ0 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LitafQ9JLJ0 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
LitafQ9JLJ0 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LitafQ9JLJ0 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LitafQ9JLJ0 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms