Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKZ2

Slc5a3, Sodium/myo-inositol cotransporter, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a3Q9JKZ2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc5a3Q9JKZ2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc5a3Q9JKZ2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc5a3Q9JKZ2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc5a3Q9JKZ2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc5a3Q9JKZ2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc5a3Q9JKZ2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc5a3Q9JKZ2 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc5a3Q9JKZ2 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc5a3Q9JKZ2 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc5a3Q9JKZ2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc5a3Q9JKZ2 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc5a3Q9JKZ2 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc5a3Q9JKZ2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc5a3Q9JKZ2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc5a3Q9JKZ2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc5a3Q9JKZ2 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc5a3Q9JKZ2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc5a3Q9JKZ2 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc5a3Q9JKZ2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc5a3Q9JKZ2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc5a3Q9JKZ2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc5a3Q9JKZ2 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc5a3Q9JKZ2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc5a3Q9JKZ2 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc5a3Q9JKZ2 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc5a3Q9JKZ2 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc5a3Q9JKZ2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc5a3Q9JKZ2 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc5a3Q9JKZ2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Slc5a3Q9JKZ2 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc5a3Q9JKZ2 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc5a3Q9JKZ2 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc5a3Q9JKZ2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc5a3Q9JKZ2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc5a3Q9JKZ2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc5a3Q9JKZ2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc5a3Q9JKZ2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc5a3Q9JKZ2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc5a3Q9JKZ2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc5a3Q9JKZ2 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc5a3Q9JKZ2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc5a3Q9JKZ2 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc5a3Q9JKZ2 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc5a3Q9JKZ2 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc5a3Q9JKZ2 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc5a3Q9JKZ2 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc5a3Q9JKZ2 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc5a3Q9JKZ2 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc5a3Q9JKZ2 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc5a3Q9JKZ2 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc5a3Q9JKZ2 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc5a3Q9JKZ2 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc5a3Q9JKZ2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc5a3Q9JKZ2 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc5a3Q9JKZ2 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc5a3Q9JKZ2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Slc5a3Q9JKZ2 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc5a3Q9JKZ2 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc5a3Q9JKZ2 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc5a3Q9JKZ2 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc5a3Q9JKZ2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc5a3Q9JKZ2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc5a3Q9JKZ2 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc5a3Q9JKZ2 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc5a3Q9JKZ2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc5a3Q9JKZ2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc5a3Q9JKZ2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc5a3Q9JKZ2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc5a3Q9JKZ2 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc5a3Q9JKZ2 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc5a3Q9JKZ2 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc5a3Q9JKZ2 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc5a3Q9JKZ2 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc5a3Q9JKZ2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc5a3Q9JKZ2 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc5a3Q9JKZ2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc5a3Q9JKZ2 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc5a3Q9JKZ2 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc5a3Q9JKZ2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc5a3Q9JKZ2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc5a3Q9JKZ2 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc5a3Q9JKZ2 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc5a3Q9JKZ2 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc5a3Q9JKZ2 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc5a3Q9JKZ2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Slc5a3Q9JKZ2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc5a3Q9JKZ2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc5a3Q9JKZ2 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc5a3Q9JKZ2 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc5a3Q9JKZ2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc5a3Q9JKZ2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc5a3Q9JKZ2 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc5a3Q9JKZ2 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc5a3Q9JKZ2 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc5a3Q9JKZ2 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc5a3Q9JKZ2 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc5a3Q9JKZ2 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc5a3Q9JKZ2 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc5a3Q9JKZ2 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.4 ms