Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Mrpl39Q9JKF7 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Mrpl39Q9JKF7 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Mrpl39Q9JKF7 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Mrpl39Q9JKF7 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Mrpl39Q9JKF7 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Mrpl39Q9JKF7 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Mrpl39Q9JKF7 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Mrpl39Q9JKF7 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Mrpl39Q9JKF7 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Mrpl39Q9JKF7 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Mrpl39Q9JKF7 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Mrpl39Q9JKF7 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Mrpl39Q9JKF7 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Mrpl39Q9JKF7 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Mrpl39Q9JKF7 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Mrpl39Q9JKF7 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Mrpl39Q9JKF7 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Mrpl39Q9JKF7 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Mrpl39Q9JKF7 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Mrpl39Q9JKF7 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Mrpl39Q9JKF7 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Mrpl39Q9JKF7 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Mrpl39Q9JKF7 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Mrpl39Q9JKF7 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Mrpl39Q9JKF7 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Mrpl39Q9JKF7 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Mrpl39Q9JKF7 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Mrpl39Q9JKF7 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Mrpl39Q9JKF7 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Mrpl39Q9JKF7 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Mrpl39Q9JKF7 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Mrpl39Q9JKF7 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Mrpl39Q9JKF7 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Mrpl39Q9JKF7 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Mrpl39Q9JKF7 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Mrpl39Q9JKF7 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Mrpl39Q9JKF7 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Mrpl39Q9JKF7 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Mrpl39Q9JKF7 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Mrpl39Q9JKF7 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Mrpl39Q9JKF7 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Mrpl39Q9JKF7 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Mrpl39Q9JKF7 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Mrpl39Q9JKF7 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Mrpl39Q9JKF7 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Mrpl39Q9JKF7 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Mrpl39Q9JKF7 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Mrpl39Q9JKF7 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Mrpl39Q9JKF7 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Mrpl39Q9JKF7 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Mrpl39Q9JKF7 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Mrpl39Q9JKF7 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Mrpl39Q9JKF7 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Mrpl39Q9JKF7 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Mrpl39Q9JKF7 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Mrpl39Q9JKF7 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mrpl39Q9JKF7 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Mrpl39Q9JKF7 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mrpl39Q9JKF7 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mrpl39Q9JKF7 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mrpl39Q9JKF7 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mrpl39Q9JKF7 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mrpl39Q9JKF7 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mrpl39Q9JKF7 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mrpl39Q9JKF7 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Mrpl39Q9JKF7 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mrpl39Q9JKF7 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mrpl39Q9JKF7 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mrpl39Q9JKF7 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mrpl39Q9JKF7 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mrpl39Q9JKF7 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mrpl39Q9JKF7 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mrpl39Q9JKF7 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mrpl39Q9JKF7 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mrpl39Q9JKF7 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mrpl39Q9JKF7 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mrpl39Q9JKF7 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mrpl39Q9JKF7 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Mrpl39Q9JKF7 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mrpl39Q9JKF7 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mrpl39Q9JKF7 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Mrpl39Q9JKF7 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Mrpl39Q9JKF7 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Mrpl39Q9JKF7 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Mrpl39Q9JKF7 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Mrpl39Q9JKF7 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Mrpl39Q9JKF7 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Mrpl39Q9JKF7 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Mrpl39Q9JKF7 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Mrpl39Q9JKF7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Mrpl39Q9JKF7 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Mrpl39Q9JKF7 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Mrpl39Q9JKF7 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Mrpl39Q9JKF7 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Mrpl39Q9JKF7 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Mrpl39Q9JKF7 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Mrpl39Q9JKF7 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Mrpl39Q9JKF7 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Mrpl39Q9JKF7 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms