Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIG8

Praf2, PRA1 family protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Praf2Q9JIG8 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Praf2Q9JIG8 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Praf2Q9JIG8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Praf2Q9JIG8 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Praf2Q9JIG8 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Praf2Q9JIG8 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Praf2Q9JIG8 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Praf2Q9JIG8 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Praf2Q9JIG8 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Praf2Q9JIG8 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Praf2Q9JIG8 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Praf2Q9JIG8 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Praf2Q9JIG8 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Praf2Q9JIG8 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Praf2Q9JIG8 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Praf2Q9JIG8 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Praf2Q9JIG8 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Praf2Q9JIG8 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Praf2Q9JIG8 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Praf2Q9JIG8 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Praf2Q9JIG8 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Praf2Q9JIG8 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Praf2Q9JIG8 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Praf2Q9JIG8 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Praf2Q9JIG8 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Praf2Q9JIG8 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Praf2Q9JIG8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Praf2Q9JIG8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Praf2Q9JIG8 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Praf2Q9JIG8 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Praf2Q9JIG8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Praf2Q9JIG8 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Praf2Q9JIG8 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Praf2Q9JIG8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Praf2Q9JIG8 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Praf2Q9JIG8 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Praf2Q9JIG8 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Praf2Q9JIG8 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Praf2Q9JIG8 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Praf2Q9JIG8 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Praf2Q9JIG8 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Praf2Q9JIG8 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Praf2Q9JIG8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Praf2Q9JIG8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Praf2Q9JIG8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Praf2Q9JIG8 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Praf2Q9JIG8 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Praf2Q9JIG8 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Praf2Q9JIG8 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Praf2Q9JIG8 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Praf2Q9JIG8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Praf2Q9JIG8 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Praf2Q9JIG8 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Praf2Q9JIG8 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Praf2Q9JIG8 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Praf2Q9JIG8 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Praf2Q9JIG8 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Praf2Q9JIG8 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Praf2Q9JIG8 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Praf2Q9JIG8 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Praf2Q9JIG8 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Praf2Q9JIG8 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Praf2Q9JIG8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Praf2Q9JIG8 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Praf2Q9JIG8 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Praf2Q9JIG8 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Praf2Q9JIG8 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Praf2Q9JIG8 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Praf2Q9JIG8 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Praf2Q9JIG8 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Praf2Q9JIG8 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Praf2Q9JIG8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Praf2Q9JIG8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Praf2Q9JIG8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Praf2Q9JIG8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Praf2Q9JIG8 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Praf2Q9JIG8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Praf2Q9JIG8 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Praf2Q9JIG8 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Praf2Q9JIG8 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Praf2Q9JIG8 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Praf2Q9JIG8 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Praf2Q9JIG8 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Praf2Q9JIG8 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Praf2Q9JIG8 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Praf2Q9JIG8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Praf2Q9JIG8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Praf2Q9JIG8 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Praf2Q9JIG8 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Praf2Q9JIG8 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Praf2Q9JIG8 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Praf2Q9JIG8 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Praf2Q9JIG8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Praf2Q9JIG8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Praf2Q9JIG8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Praf2Q9JIG8 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Praf2Q9JIG8 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Praf2Q9JIG8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Praf2Q9JIG8 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Praf2Q9JIG8 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms