Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES61

Ms4a4b, Chandra protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4bQ9ES61 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ms4a4bQ9ES61 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ms4a4bQ9ES61 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ms4a4bQ9ES61 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ms4a4bQ9ES61 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ms4a4bQ9ES61 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ms4a4bQ9ES61 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ms4a4bQ9ES61 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ms4a4bQ9ES61 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ms4a4bQ9ES61 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ms4a4bQ9ES61 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ms4a4bQ9ES61 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ms4a4bQ9ES61 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ms4a4bQ9ES61 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ms4a4bQ9ES61 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ms4a4bQ9ES61 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ms4a4bQ9ES61 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ms4a4bQ9ES61 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ms4a4bQ9ES61 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ms4a4bQ9ES61 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ms4a4bQ9ES61 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ms4a4bQ9ES61 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ms4a4bQ9ES61 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ms4a4bQ9ES61 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ms4a4bQ9ES61 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ms4a4bQ9ES61 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ms4a4bQ9ES61 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ms4a4bQ9ES61 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ms4a4bQ9ES61 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ms4a4bQ9ES61 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ms4a4bQ9ES61 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ms4a4bQ9ES61 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ms4a4bQ9ES61 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ms4a4bQ9ES61 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Ms4a4bQ9ES61 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ms4a4bQ9ES61 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ms4a4bQ9ES61 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ms4a4bQ9ES61 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ms4a4bQ9ES61 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ms4a4bQ9ES61 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ms4a4bQ9ES61 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ms4a4bQ9ES61 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ms4a4bQ9ES61 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ms4a4bQ9ES61 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ms4a4bQ9ES61 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ms4a4bQ9ES61 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ms4a4bQ9ES61 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ms4a4bQ9ES61 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ms4a4bQ9ES61 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ms4a4bQ9ES61 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ms4a4bQ9ES61 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ms4a4bQ9ES61 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ms4a4bQ9ES61 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ms4a4bQ9ES61 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ms4a4bQ9ES61 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ms4a4bQ9ES61 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ms4a4bQ9ES61 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ms4a4bQ9ES61 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ms4a4bQ9ES61 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ms4a4bQ9ES61 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ms4a4bQ9ES61 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ms4a4bQ9ES61 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ms4a4bQ9ES61 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ms4a4bQ9ES61 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ms4a4bQ9ES61 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ms4a4bQ9ES61 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ms4a4bQ9ES61 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ms4a4bQ9ES61 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ms4a4bQ9ES61 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ms4a4bQ9ES61 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ms4a4bQ9ES61 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ms4a4bQ9ES61 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ms4a4bQ9ES61 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ms4a4bQ9ES61 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ms4a4bQ9ES61 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ms4a4bQ9ES61 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ms4a4bQ9ES61 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ms4a4bQ9ES61 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ms4a4bQ9ES61 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ms4a4bQ9ES61 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ms4a4bQ9ES61 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ms4a4bQ9ES61 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ms4a4bQ9ES61 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ms4a4bQ9ES61 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ms4a4bQ9ES61 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ms4a4bQ9ES61 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ms4a4bQ9ES61 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ms4a4bQ9ES61 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ms4a4bQ9ES61 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ms4a4bQ9ES61 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ms4a4bQ9ES61 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ms4a4bQ9ES61 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ms4a4bQ9ES61 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ms4a4bQ9ES61 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ms4a4bQ9ES61 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ms4a4bQ9ES61 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ms4a4bQ9ES61 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ms4a4bQ9ES61 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ms4a4bQ9ES61 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ms4a4bQ9ES61 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.9 ms