Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPK8

Trpv4, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 4, mousemouse

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv4Q9EPK8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trpv4Q9EPK8 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trpv4Q9EPK8 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Trpv4Q9EPK8 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trpv4Q9EPK8 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trpv4Q9EPK8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trpv4Q9EPK8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trpv4Q9EPK8 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trpv4Q9EPK8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trpv4Q9EPK8 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trpv4Q9EPK8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trpv4Q9EPK8 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trpv4Q9EPK8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trpv4Q9EPK8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trpv4Q9EPK8 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trpv4Q9EPK8 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Trpv4Q9EPK8 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trpv4Q9EPK8 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trpv4Q9EPK8 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Trpv4Q9EPK8 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trpv4Q9EPK8 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trpv4Q9EPK8 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trpv4Q9EPK8 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trpv4Q9EPK8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trpv4Q9EPK8 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Trpv4Q9EPK8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trpv4Q9EPK8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trpv4Q9EPK8 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trpv4Q9EPK8 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trpv4Q9EPK8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trpv4Q9EPK8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trpv4Q9EPK8 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trpv4Q9EPK8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trpv4Q9EPK8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trpv4Q9EPK8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trpv4Q9EPK8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trpv4Q9EPK8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trpv4Q9EPK8 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trpv4Q9EPK8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trpv4Q9EPK8 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trpv4Q9EPK8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trpv4Q9EPK8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trpv4Q9EPK8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Trpv4Q9EPK8 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trpv4Q9EPK8 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trpv4Q9EPK8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trpv4Q9EPK8 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trpv4Q9EPK8 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Trpv4Q9EPK8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trpv4Q9EPK8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trpv4Q9EPK8 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trpv4Q9EPK8 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trpv4Q9EPK8 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trpv4Q9EPK8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trpv4Q9EPK8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trpv4Q9EPK8 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trpv4Q9EPK8 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trpv4Q9EPK8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trpv4Q9EPK8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trpv4Q9EPK8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Trpv4Q9EPK8 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trpv4Q9EPK8 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trpv4Q9EPK8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trpv4Q9EPK8 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trpv4Q9EPK8 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trpv4Q9EPK8 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trpv4Q9EPK8 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Trpv4Q9EPK8 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Trpv4Q9EPK8 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Trpv4Q9EPK8 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trpv4Q9EPK8 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trpv4Q9EPK8 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trpv4Q9EPK8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trpv4Q9EPK8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trpv4Q9EPK8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trpv4Q9EPK8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trpv4Q9EPK8 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trpv4Q9EPK8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trpv4Q9EPK8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trpv4Q9EPK8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trpv4Q9EPK8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trpv4Q9EPK8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trpv4Q9EPK8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trpv4Q9EPK8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trpv4Q9EPK8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trpv4Q9EPK8 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trpv4Q9EPK8 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trpv4Q9EPK8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trpv4Q9EPK8 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Trpv4Q9EPK8 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trpv4Q9EPK8 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trpv4Q9EPK8 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trpv4Q9EPK8 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trpv4Q9EPK8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trpv4Q9EPK8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trpv4Q9EPK8 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trpv4Q9EPK8 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Trpv4Q9EPK8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trpv4Q9EPK8 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trpv4Q9EPK8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 130.4 ms