Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCD6

Gabarap, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabarapQ9DCD6 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GabarapQ9DCD6 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GabarapQ9DCD6 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GabarapQ9DCD6 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
GabarapQ9DCD6 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GabarapQ9DCD6 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GabarapQ9DCD6 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GabarapQ9DCD6 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
GabarapQ9DCD6 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GabarapQ9DCD6 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GabarapQ9DCD6 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GabarapQ9DCD6 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GabarapQ9DCD6 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GabarapQ9DCD6 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GabarapQ9DCD6 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GabarapQ9DCD6 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GabarapQ9DCD6 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GabarapQ9DCD6 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GabarapQ9DCD6 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GabarapQ9DCD6 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GabarapQ9DCD6 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GabarapQ9DCD6 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GabarapQ9DCD6 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GabarapQ9DCD6 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GabarapQ9DCD6 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GabarapQ9DCD6 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GabarapQ9DCD6 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GabarapQ9DCD6 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GabarapQ9DCD6 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GabarapQ9DCD6 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GabarapQ9DCD6 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GabarapQ9DCD6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GabarapQ9DCD6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GabarapQ9DCD6 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GabarapQ9DCD6 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GabarapQ9DCD6 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GabarapQ9DCD6 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GabarapQ9DCD6 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GabarapQ9DCD6 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GabarapQ9DCD6 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GabarapQ9DCD6 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GabarapQ9DCD6 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GabarapQ9DCD6 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GabarapQ9DCD6 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GabarapQ9DCD6 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GabarapQ9DCD6 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GabarapQ9DCD6 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GabarapQ9DCD6 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GabarapQ9DCD6 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GabarapQ9DCD6 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GabarapQ9DCD6 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GabarapQ9DCD6 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GabarapQ9DCD6 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GabarapQ9DCD6 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GabarapQ9DCD6 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GabarapQ9DCD6 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GabarapQ9DCD6 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GabarapQ9DCD6 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GabarapQ9DCD6 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GabarapQ9DCD6 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GabarapQ9DCD6 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GabarapQ9DCD6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GabarapQ9DCD6 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GabarapQ9DCD6 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GabarapQ9DCD6 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GabarapQ9DCD6 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GabarapQ9DCD6 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GabarapQ9DCD6 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GabarapQ9DCD6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GabarapQ9DCD6 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GabarapQ9DCD6 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GabarapQ9DCD6 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GabarapQ9DCD6 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GabarapQ9DCD6 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GabarapQ9DCD6 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
GabarapQ9DCD6 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GabarapQ9DCD6 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GabarapQ9DCD6 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GabarapQ9DCD6 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GabarapQ9DCD6 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GabarapQ9DCD6 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GabarapQ9DCD6 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GabarapQ9DCD6 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GabarapQ9DCD6 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GabarapQ9DCD6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GabarapQ9DCD6 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GabarapQ9DCD6 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GabarapQ9DCD6 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GabarapQ9DCD6 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GabarapQ9DCD6 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GabarapQ9DCD6 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GabarapQ9DCD6 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GabarapQ9DCD6 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GabarapQ9DCD6 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GabarapQ9DCD6 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GabarapQ9DCD6 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GabarapQ9DCD6 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GabarapQ9DCD6 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GabarapQ9DCD6 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GabarapQ9DCD6 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.4 ms