Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBQ9

Swt1, Transcriptional protein SWT1, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Swt1Q9DBQ9 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Swt1Q9DBQ9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Swt1Q9DBQ9 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Swt1Q9DBQ9 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Swt1Q9DBQ9 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Swt1Q9DBQ9 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Swt1Q9DBQ9 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Swt1Q9DBQ9 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Swt1Q9DBQ9 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Swt1Q9DBQ9 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Swt1Q9DBQ9 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Swt1Q9DBQ9 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Swt1Q9DBQ9 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Swt1Q9DBQ9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Swt1Q9DBQ9 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Swt1Q9DBQ9 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Swt1Q9DBQ9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Swt1Q9DBQ9 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Swt1Q9DBQ9 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Swt1Q9DBQ9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Swt1Q9DBQ9 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Swt1Q9DBQ9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Swt1Q9DBQ9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
Swt1Q9DBQ9 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Swt1Q9DBQ9 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Swt1Q9DBQ9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Swt1Q9DBQ9 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Swt1Q9DBQ9 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Swt1Q9DBQ9 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Swt1Q9DBQ9 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Swt1Q9DBQ9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Swt1Q9DBQ9 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Swt1Q9DBQ9 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Swt1Q9DBQ9 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Swt1Q9DBQ9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Swt1Q9DBQ9 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Swt1Q9DBQ9 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Swt1Q9DBQ9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Swt1Q9DBQ9 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Swt1Q9DBQ9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Swt1Q9DBQ9 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Swt1Q9DBQ9 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Swt1Q9DBQ9 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Swt1Q9DBQ9 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Swt1Q9DBQ9 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Swt1Q9DBQ9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Swt1Q9DBQ9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Swt1Q9DBQ9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Swt1Q9DBQ9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Swt1Q9DBQ9 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Swt1Q9DBQ9 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Swt1Q9DBQ9 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Swt1Q9DBQ9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Swt1Q9DBQ9 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Swt1Q9DBQ9 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Swt1Q9DBQ9 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Swt1Q9DBQ9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Swt1Q9DBQ9 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Swt1Q9DBQ9 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
Swt1Q9DBQ9 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Swt1Q9DBQ9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Swt1Q9DBQ9 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Swt1Q9DBQ9 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
Swt1Q9DBQ9 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Swt1Q9DBQ9 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Swt1Q9DBQ9 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Swt1Q9DBQ9 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Swt1Q9DBQ9 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Swt1Q9DBQ9 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
Swt1Q9DBQ9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Swt1Q9DBQ9 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Swt1Q9DBQ9 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Swt1Q9DBQ9 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Swt1Q9DBQ9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Swt1Q9DBQ9 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Swt1Q9DBQ9 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Swt1Q9DBQ9 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Swt1Q9DBQ9 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Swt1Q9DBQ9 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
Swt1Q9DBQ9 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Swt1Q9DBQ9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Swt1Q9DBQ9 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Swt1Q9DBQ9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Swt1Q9DBQ9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Swt1Q9DBQ9 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Swt1Q9DBQ9 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Swt1Q9DBQ9 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Swt1Q9DBQ9 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Swt1Q9DBQ9 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Swt1Q9DBQ9 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Swt1Q9DBQ9 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Swt1Q9DBQ9 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Swt1Q9DBQ9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Swt1Q9DBQ9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Swt1Q9DBQ9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Swt1Q9DBQ9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Swt1Q9DBQ9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Swt1Q9DBQ9 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Swt1Q9DBQ9 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Swt1Q9DBQ9 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms