Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pop5Q9DB28 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pop5Q9DB28 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Pop5Q9DB28 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pop5Q9DB28 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pop5Q9DB28 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pop5Q9DB28 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pop5Q9DB28 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pop5Q9DB28 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pop5Q9DB28 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pop5Q9DB28 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pop5Q9DB28 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pop5Q9DB28 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pop5Q9DB28 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pop5Q9DB28 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pop5Q9DB28 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pop5Q9DB28 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pop5Q9DB28 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pop5Q9DB28 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pop5Q9DB28 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pop5Q9DB28 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pop5Q9DB28 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pop5Q9DB28 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pop5Q9DB28 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pop5Q9DB28 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pop5Q9DB28 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pop5Q9DB28 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pop5Q9DB28 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pop5Q9DB28 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pop5Q9DB28 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pop5Q9DB28 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pop5Q9DB28 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pop5Q9DB28 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pop5Q9DB28 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pop5Q9DB28 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pop5Q9DB28 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pop5Q9DB28 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pop5Q9DB28 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pop5Q9DB28 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pop5Q9DB28 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pop5Q9DB28 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pop5Q9DB28 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pop5Q9DB28 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pop5Q9DB28 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pop5Q9DB28 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pop5Q9DB28 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pop5Q9DB28 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pop5Q9DB28 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pop5Q9DB28 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pop5Q9DB28 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pop5Q9DB28 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pop5Q9DB28 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pop5Q9DB28 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pop5Q9DB28 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Pop5Q9DB28 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pop5Q9DB28 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pop5Q9DB28 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pop5Q9DB28 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pop5Q9DB28 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pop5Q9DB28 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pop5Q9DB28 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pop5Q9DB28 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pop5Q9DB28 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Pop5Q9DB28 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pop5Q9DB28 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pop5Q9DB28 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pop5Q9DB28 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pop5Q9DB28 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pop5Q9DB28 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pop5Q9DB28 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pop5Q9DB28 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pop5Q9DB28 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pop5Q9DB28 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pop5Q9DB28 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pop5Q9DB28 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pop5Q9DB28 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pop5Q9DB28 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pop5Q9DB28 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pop5Q9DB28 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pop5Q9DB28 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pop5Q9DB28 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pop5Q9DB28 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pop5Q9DB28 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pop5Q9DB28 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pop5Q9DB28 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pop5Q9DB28 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Pop5Q9DB28 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pop5Q9DB28 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pop5Q9DB28 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pop5Q9DB28 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pop5Q9DB28 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pop5Q9DB28 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pop5Q9DB28 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Pop5Q9DB28 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pop5Q9DB28 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pop5Q9DB28 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pop5Q9DB28 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pop5Q9DB28 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pop5Q9DB28 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pop5Q9DB28 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms