Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAW6

Prpf4, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf4Q9DAW6 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Prpf4Q9DAW6 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Prpf4Q9DAW6 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Prpf4Q9DAW6 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Prpf4Q9DAW6 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Prpf4Q9DAW6 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Prpf4Q9DAW6 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Prpf4Q9DAW6 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Prpf4Q9DAW6 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Prpf4Q9DAW6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Prpf4Q9DAW6 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Prpf4Q9DAW6 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Prpf4Q9DAW6 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Prpf4Q9DAW6 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Prpf4Q9DAW6 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Prpf4Q9DAW6 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Prpf4Q9DAW6 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Prpf4Q9DAW6 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Prpf4Q9DAW6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Prpf4Q9DAW6 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Prpf4Q9DAW6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Prpf4Q9DAW6 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Prpf4Q9DAW6 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Prpf4Q9DAW6 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Prpf4Q9DAW6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Prpf4Q9DAW6 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Prpf4Q9DAW6 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Prpf4Q9DAW6 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Prpf4Q9DAW6 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Prpf4Q9DAW6 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Prpf4Q9DAW6 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Prpf4Q9DAW6 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Prpf4Q9DAW6 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Prpf4Q9DAW6 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Prpf4Q9DAW6 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Prpf4Q9DAW6 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Prpf4Q9DAW6 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Prpf4Q9DAW6 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Prpf4Q9DAW6 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Prpf4Q9DAW6 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Prpf4Q9DAW6 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Prpf4Q9DAW6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Prpf4Q9DAW6 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Prpf4Q9DAW6 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Prpf4Q9DAW6 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Prpf4Q9DAW6 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Prpf4Q9DAW6 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Prpf4Q9DAW6 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Prpf4Q9DAW6 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Prpf4Q9DAW6 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Prpf4Q9DAW6 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Prpf4Q9DAW6 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Prpf4Q9DAW6 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Prpf4Q9DAW6 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Prpf4Q9DAW6 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Prpf4Q9DAW6 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Prpf4Q9DAW6 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Prpf4Q9DAW6 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Prpf4Q9DAW6 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Prpf4Q9DAW6 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Prpf4Q9DAW6 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Prpf4Q9DAW6 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prpf4Q9DAW6 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prpf4Q9DAW6 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prpf4Q9DAW6 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Prpf4Q9DAW6 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Prpf4Q9DAW6 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prpf4Q9DAW6 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prpf4Q9DAW6 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prpf4Q9DAW6 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Prpf4Q9DAW6 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prpf4Q9DAW6 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Prpf4Q9DAW6 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Prpf4Q9DAW6 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Prpf4Q9DAW6 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Prpf4Q9DAW6 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prpf4Q9DAW6 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prpf4Q9DAW6 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Prpf4Q9DAW6 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prpf4Q9DAW6 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prpf4Q9DAW6 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prpf4Q9DAW6 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prpf4Q9DAW6 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prpf4Q9DAW6 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Prpf4Q9DAW6 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prpf4Q9DAW6 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prpf4Q9DAW6 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prpf4Q9DAW6 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prpf4Q9DAW6 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prpf4Q9DAW6 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prpf4Q9DAW6 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prpf4Q9DAW6 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prpf4Q9DAW6 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prpf4Q9DAW6 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prpf4Q9DAW6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prpf4Q9DAW6 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prpf4Q9DAW6 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prpf4Q9DAW6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prpf4Q9DAW6 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prpf4Q9DAW6 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.7 ms