Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA39

Tmbim4, Protein lifeguard 4, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmbim4Q9DA39 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmbim4Q9DA39 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmbim4Q9DA39 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmbim4Q9DA39 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmbim4Q9DA39 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmbim4Q9DA39 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmbim4Q9DA39 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmbim4Q9DA39 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmbim4Q9DA39 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmbim4Q9DA39 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmbim4Q9DA39 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmbim4Q9DA39 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmbim4Q9DA39 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmbim4Q9DA39 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmbim4Q9DA39 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmbim4Q9DA39 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmbim4Q9DA39 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmbim4Q9DA39 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmbim4Q9DA39 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmbim4Q9DA39 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmbim4Q9DA39 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmbim4Q9DA39 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmbim4Q9DA39 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmbim4Q9DA39 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmbim4Q9DA39 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmbim4Q9DA39 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmbim4Q9DA39 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmbim4Q9DA39 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmbim4Q9DA39 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmbim4Q9DA39 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmbim4Q9DA39 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmbim4Q9DA39 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmbim4Q9DA39 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmbim4Q9DA39 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmbim4Q9DA39 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmbim4Q9DA39 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmbim4Q9DA39 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmbim4Q9DA39 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmbim4Q9DA39 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmbim4Q9DA39 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmbim4Q9DA39 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmbim4Q9DA39 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmbim4Q9DA39 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmbim4Q9DA39 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmbim4Q9DA39 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmbim4Q9DA39 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmbim4Q9DA39 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tmbim4Q9DA39 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tmbim4Q9DA39 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmbim4Q9DA39 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmbim4Q9DA39 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmbim4Q9DA39 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmbim4Q9DA39 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmbim4Q9DA39 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmbim4Q9DA39 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmbim4Q9DA39 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmbim4Q9DA39 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmbim4Q9DA39 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmbim4Q9DA39 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmbim4Q9DA39 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmbim4Q9DA39 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmbim4Q9DA39 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmbim4Q9DA39 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmbim4Q9DA39 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmbim4Q9DA39 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmbim4Q9DA39 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmbim4Q9DA39 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmbim4Q9DA39 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmbim4Q9DA39 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmbim4Q9DA39 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmbim4Q9DA39 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmbim4Q9DA39 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmbim4Q9DA39 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmbim4Q9DA39 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmbim4Q9DA39 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmbim4Q9DA39 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmbim4Q9DA39 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmbim4Q9DA39 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmbim4Q9DA39 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmbim4Q9DA39 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmbim4Q9DA39 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmbim4Q9DA39 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmbim4Q9DA39 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmbim4Q9DA39 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmbim4Q9DA39 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmbim4Q9DA39 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmbim4Q9DA39 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmbim4Q9DA39 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmbim4Q9DA39 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmbim4Q9DA39 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmbim4Q9DA39 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmbim4Q9DA39 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmbim4Q9DA39 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmbim4Q9DA39 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmbim4Q9DA39 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmbim4Q9DA39 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmbim4Q9DA39 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmbim4Q9DA39 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmbim4Q9DA39 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmbim4Q9DA39 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms