Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9L5

Actrt2, Actin-related protein T2, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actrt2Q9D9L5 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Actrt2Q9D9L5 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Actrt2Q9D9L5 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Actrt2Q9D9L5 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Actrt2Q9D9L5 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Actrt2Q9D9L5 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Actrt2Q9D9L5 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Actrt2Q9D9L5 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Actrt2Q9D9L5 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Actrt2Q9D9L5 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Actrt2Q9D9L5 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Actrt2Q9D9L5 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Actrt2Q9D9L5 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Actrt2Q9D9L5 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Actrt2Q9D9L5 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Actrt2Q9D9L5 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Actrt2Q9D9L5 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Actrt2Q9D9L5 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Actrt2Q9D9L5 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Actrt2Q9D9L5 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Actrt2Q9D9L5 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Actrt2Q9D9L5 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Actrt2Q9D9L5 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Actrt2Q9D9L5 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Actrt2Q9D9L5 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Actrt2Q9D9L5 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Actrt2Q9D9L5 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Actrt2Q9D9L5 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Actrt2Q9D9L5 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Actrt2Q9D9L5 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Actrt2Q9D9L5 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Actrt2Q9D9L5 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Actrt2Q9D9L5 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Actrt2Q9D9L5 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Actrt2Q9D9L5 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Actrt2Q9D9L5 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Actrt2Q9D9L5 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Actrt2Q9D9L5 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Actrt2Q9D9L5 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Actrt2Q9D9L5 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Actrt2Q9D9L5 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Actrt2Q9D9L5 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Actrt2Q9D9L5 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Actrt2Q9D9L5 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Actrt2Q9D9L5 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Actrt2Q9D9L5 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Actrt2Q9D9L5 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Actrt2Q9D9L5 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Actrt2Q9D9L5 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Actrt2Q9D9L5 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Actrt2Q9D9L5 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Actrt2Q9D9L5 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Actrt2Q9D9L5 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Actrt2Q9D9L5 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Actrt2Q9D9L5 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Actrt2Q9D9L5 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Actrt2Q9D9L5 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Actrt2Q9D9L5 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Actrt2Q9D9L5 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Actrt2Q9D9L5 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Actrt2Q9D9L5 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Actrt2Q9D9L5 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Actrt2Q9D9L5 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Actrt2Q9D9L5 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Actrt2Q9D9L5 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Actrt2Q9D9L5 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Actrt2Q9D9L5 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Actrt2Q9D9L5 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Actrt2Q9D9L5 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Actrt2Q9D9L5 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Actrt2Q9D9L5 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Actrt2Q9D9L5 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Actrt2Q9D9L5 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Actrt2Q9D9L5 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Actrt2Q9D9L5 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Actrt2Q9D9L5 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Actrt2Q9D9L5 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Actrt2Q9D9L5 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Actrt2Q9D9L5 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Actrt2Q9D9L5 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Actrt2Q9D9L5 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Actrt2Q9D9L5 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Actrt2Q9D9L5 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Actrt2Q9D9L5 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Actrt2Q9D9L5 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Actrt2Q9D9L5 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Actrt2Q9D9L5 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Actrt2Q9D9L5 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Actrt2Q9D9L5 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Actrt2Q9D9L5 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Actrt2Q9D9L5 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Actrt2Q9D9L5 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Actrt2Q9D9L5 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Actrt2Q9D9L5 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Actrt2Q9D9L5 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Actrt2Q9D9L5 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Actrt2Q9D9L5 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Actrt2Q9D9L5 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Actrt2Q9D9L5 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Actrt2Q9D9L5 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms