Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U8

Snx5, Sorting nexin-5, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx5Q9D8U8 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Snx5Q9D8U8 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Snx5Q9D8U8 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Snx5Q9D8U8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Snx5Q9D8U8 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Snx5Q9D8U8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Snx5Q9D8U8 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Snx5Q9D8U8 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Snx5Q9D8U8 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Snx5Q9D8U8 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Snx5Q9D8U8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Snx5Q9D8U8 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Snx5Q9D8U8 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Snx5Q9D8U8 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Snx5Q9D8U8 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Snx5Q9D8U8 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Snx5Q9D8U8 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Snx5Q9D8U8 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Snx5Q9D8U8 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Snx5Q9D8U8 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Snx5Q9D8U8 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Snx5Q9D8U8 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Snx5Q9D8U8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Snx5Q9D8U8 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Snx5Q9D8U8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Snx5Q9D8U8 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Snx5Q9D8U8 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Snx5Q9D8U8 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Snx5Q9D8U8 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Snx5Q9D8U8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Snx5Q9D8U8 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Snx5Q9D8U8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Snx5Q9D8U8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Snx5Q9D8U8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Snx5Q9D8U8 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Snx5Q9D8U8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Snx5Q9D8U8 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Snx5Q9D8U8 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Snx5Q9D8U8 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Snx5Q9D8U8 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Snx5Q9D8U8 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Snx5Q9D8U8 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Snx5Q9D8U8 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Snx5Q9D8U8 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Snx5Q9D8U8 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Snx5Q9D8U8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Snx5Q9D8U8 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Snx5Q9D8U8 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Snx5Q9D8U8 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Snx5Q9D8U8 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Snx5Q9D8U8 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Snx5Q9D8U8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Snx5Q9D8U8 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Snx5Q9D8U8 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Snx5Q9D8U8 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Snx5Q9D8U8 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Snx5Q9D8U8 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Snx5Q9D8U8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Snx5Q9D8U8 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Snx5Q9D8U8 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Snx5Q9D8U8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Snx5Q9D8U8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Snx5Q9D8U8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Snx5Q9D8U8 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Snx5Q9D8U8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Snx5Q9D8U8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Snx5Q9D8U8 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Snx5Q9D8U8 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Snx5Q9D8U8 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Snx5Q9D8U8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Snx5Q9D8U8 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Snx5Q9D8U8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Snx5Q9D8U8 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Snx5Q9D8U8 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Snx5Q9D8U8 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Snx5Q9D8U8 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Snx5Q9D8U8 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Snx5Q9D8U8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Snx5Q9D8U8 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Snx5Q9D8U8 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Snx5Q9D8U8 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Snx5Q9D8U8 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Snx5Q9D8U8 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Snx5Q9D8U8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Snx5Q9D8U8 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Snx5Q9D8U8 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Snx5Q9D8U8 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Snx5Q9D8U8 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Snx5Q9D8U8 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Snx5Q9D8U8 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Snx5Q9D8U8 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Snx5Q9D8U8 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Snx5Q9D8U8 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Snx5Q9D8U8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Snx5Q9D8U8 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Snx5Q9D8U8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Snx5Q9D8U8 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Snx5Q9D8U8 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Snx5Q9D8U8 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Snx5Q9D8U8 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114.9 ms