Protein–RNA interactions for Protein: Q9D883

U2af1, Splicing factor U2AF 35 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af1Q9D883 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
U2af1Q9D883 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
U2af1Q9D883 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
U2af1Q9D883 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
U2af1Q9D883 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
U2af1Q9D883 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
U2af1Q9D883 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
U2af1Q9D883 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
U2af1Q9D883 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
U2af1Q9D883 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
U2af1Q9D883 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
U2af1Q9D883 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
U2af1Q9D883 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
U2af1Q9D883 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
U2af1Q9D883 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
U2af1Q9D883 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
U2af1Q9D883 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
U2af1Q9D883 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
U2af1Q9D883 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
U2af1Q9D883 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
U2af1Q9D883 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
U2af1Q9D883 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
U2af1Q9D883 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
U2af1Q9D883 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
U2af1Q9D883 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
U2af1Q9D883 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
U2af1Q9D883 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
U2af1Q9D883 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
U2af1Q9D883 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
U2af1Q9D883 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
U2af1Q9D883 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
U2af1Q9D883 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
U2af1Q9D883 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
U2af1Q9D883 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
U2af1Q9D883 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
U2af1Q9D883 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
U2af1Q9D883 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
U2af1Q9D883 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC30■■■□□ 2.39
U2af1Q9D883 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC30■■■□□ 2.39
U2af1Q9D883 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
U2af1Q9D883 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
U2af1Q9D883 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
U2af1Q9D883 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
U2af1Q9D883 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
U2af1Q9D883 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
U2af1Q9D883 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
U2af1Q9D883 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
U2af1Q9D883 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
U2af1Q9D883 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
U2af1Q9D883 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
U2af1Q9D883 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
U2af1Q9D883 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
U2af1Q9D883 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
U2af1Q9D883 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
U2af1Q9D883 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
U2af1Q9D883 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
U2af1Q9D883 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
U2af1Q9D883 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
U2af1Q9D883 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
U2af1Q9D883 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
U2af1Q9D883 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
U2af1Q9D883 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
U2af1Q9D883 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC29.94■■■□□ 2.38
U2af1Q9D883 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
U2af1Q9D883 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
U2af1Q9D883 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
U2af1Q9D883 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
U2af1Q9D883 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
U2af1Q9D883 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
U2af1Q9D883 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
U2af1Q9D883 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
U2af1Q9D883 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
U2af1Q9D883 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
U2af1Q9D883 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
U2af1Q9D883 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
U2af1Q9D883 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
U2af1Q9D883 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
U2af1Q9D883 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
U2af1Q9D883 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
U2af1Q9D883 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC29.89■■■□□ 2.38
U2af1Q9D883 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
U2af1Q9D883 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
U2af1Q9D883 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC29.88■■■□□ 2.37
U2af1Q9D883 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
U2af1Q9D883 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
U2af1Q9D883 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
U2af1Q9D883 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
U2af1Q9D883 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
U2af1Q9D883 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
U2af1Q9D883 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
U2af1Q9D883 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
U2af1Q9D883 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
U2af1Q9D883 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
U2af1Q9D883 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
U2af1Q9D883 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
U2af1Q9D883 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
U2af1Q9D883 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
U2af1Q9D883 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
U2af1Q9D883 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
U2af1Q9D883 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms