Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J9

Echdc3, Enoyl-CoA hydratase domain-containing protein 3, mitochondrial, mousemouse

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Length 300 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Echdc3Q9D7J9 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Echdc3Q9D7J9 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Echdc3Q9D7J9 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Echdc3Q9D7J9 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Echdc3Q9D7J9 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
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Echdc3Q9D7J9 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
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Echdc3Q9D7J9 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Echdc3Q9D7J9 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
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Echdc3Q9D7J9 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Echdc3Q9D7J9 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
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Echdc3Q9D7J9 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Echdc3Q9D7J9 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
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Echdc3Q9D7J9 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
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Echdc3Q9D7J9 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Echdc3Q9D7J9 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Echdc3Q9D7J9 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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Echdc3Q9D7J9 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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Echdc3Q9D7J9 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Echdc3Q9D7J9 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Echdc3Q9D7J9 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Echdc3Q9D7J9 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Echdc3Q9D7J9 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Echdc3Q9D7J9 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Echdc3Q9D7J9 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Echdc3Q9D7J9 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Echdc3Q9D7J9 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Echdc3Q9D7J9 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Echdc3Q9D7J9 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Echdc3Q9D7J9 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Echdc3Q9D7J9 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Echdc3Q9D7J9 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
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