Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4E6

Pabpc6, Polyadenylate-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc6Q9D4E6 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pabpc6Q9D4E6 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pabpc6Q9D4E6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pabpc6Q9D4E6 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pabpc6Q9D4E6 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pabpc6Q9D4E6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pabpc6Q9D4E6 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pabpc6Q9D4E6 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pabpc6Q9D4E6 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pabpc6Q9D4E6 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pabpc6Q9D4E6 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pabpc6Q9D4E6 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pabpc6Q9D4E6 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pabpc6Q9D4E6 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pabpc6Q9D4E6 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pabpc6Q9D4E6 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pabpc6Q9D4E6 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pabpc6Q9D4E6 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pabpc6Q9D4E6 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pabpc6Q9D4E6 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pabpc6Q9D4E6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pabpc6Q9D4E6 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pabpc6Q9D4E6 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pabpc6Q9D4E6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pabpc6Q9D4E6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pabpc6Q9D4E6 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pabpc6Q9D4E6 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pabpc6Q9D4E6 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pabpc6Q9D4E6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pabpc6Q9D4E6 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pabpc6Q9D4E6 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pabpc6Q9D4E6 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pabpc6Q9D4E6 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pabpc6Q9D4E6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pabpc6Q9D4E6 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pabpc6Q9D4E6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pabpc6Q9D4E6 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pabpc6Q9D4E6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pabpc6Q9D4E6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pabpc6Q9D4E6 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pabpc6Q9D4E6 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pabpc6Q9D4E6 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pabpc6Q9D4E6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pabpc6Q9D4E6 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pabpc6Q9D4E6 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pabpc6Q9D4E6 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Pabpc6Q9D4E6 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Pabpc6Q9D4E6 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
Pabpc6Q9D4E6 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pabpc6Q9D4E6 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pabpc6Q9D4E6 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pabpc6Q9D4E6 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Pabpc6Q9D4E6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Pabpc6Q9D4E6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pabpc6Q9D4E6 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pabpc6Q9D4E6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pabpc6Q9D4E6 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pabpc6Q9D4E6 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pabpc6Q9D4E6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pabpc6Q9D4E6 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pabpc6Q9D4E6 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pabpc6Q9D4E6 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pabpc6Q9D4E6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pabpc6Q9D4E6 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pabpc6Q9D4E6 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pabpc6Q9D4E6 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pabpc6Q9D4E6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pabpc6Q9D4E6 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pabpc6Q9D4E6 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Pabpc6Q9D4E6 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pabpc6Q9D4E6 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Pabpc6Q9D4E6 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Pabpc6Q9D4E6 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pabpc6Q9D4E6 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pabpc6Q9D4E6 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Pabpc6Q9D4E6 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Pabpc6Q9D4E6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pabpc6Q9D4E6 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pabpc6Q9D4E6 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pabpc6Q9D4E6 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pabpc6Q9D4E6 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pabpc6Q9D4E6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pabpc6Q9D4E6 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pabpc6Q9D4E6 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pabpc6Q9D4E6 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pabpc6Q9D4E6 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pabpc6Q9D4E6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pabpc6Q9D4E6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pabpc6Q9D4E6 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pabpc6Q9D4E6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pabpc6Q9D4E6 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pabpc6Q9D4E6 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pabpc6Q9D4E6 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pabpc6Q9D4E6 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pabpc6Q9D4E6 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pabpc6Q9D4E6 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pabpc6Q9D4E6 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pabpc6Q9D4E6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pabpc6Q9D4E6 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pabpc6Q9D4E6 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms