Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4D2

4933402E13Rik, 4933402E13Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933402E13RikQ9D4D2 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
4933402E13RikQ9D4D2 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
4933402E13RikQ9D4D2 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
4933402E13RikQ9D4D2 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
4933402E13RikQ9D4D2 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
4933402E13RikQ9D4D2 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
4933402E13RikQ9D4D2 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
4933402E13RikQ9D4D2 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
4933402E13RikQ9D4D2 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
4933402E13RikQ9D4D2 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
4933402E13RikQ9D4D2 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
4933402E13RikQ9D4D2 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
4933402E13RikQ9D4D2 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
4933402E13RikQ9D4D2 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
4933402E13RikQ9D4D2 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
4933402E13RikQ9D4D2 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
4933402E13RikQ9D4D2 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
4933402E13RikQ9D4D2 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
4933402E13RikQ9D4D2 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
4933402E13RikQ9D4D2 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
4933402E13RikQ9D4D2 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
4933402E13RikQ9D4D2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
4933402E13RikQ9D4D2 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
4933402E13RikQ9D4D2 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
4933402E13RikQ9D4D2 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
4933402E13RikQ9D4D2 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
4933402E13RikQ9D4D2 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
4933402E13RikQ9D4D2 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
4933402E13RikQ9D4D2 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
4933402E13RikQ9D4D2 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
4933402E13RikQ9D4D2 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
4933402E13RikQ9D4D2 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
4933402E13RikQ9D4D2 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
4933402E13RikQ9D4D2 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
4933402E13RikQ9D4D2 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
4933402E13RikQ9D4D2 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
4933402E13RikQ9D4D2 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
4933402E13RikQ9D4D2 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
4933402E13RikQ9D4D2 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
4933402E13RikQ9D4D2 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
4933402E13RikQ9D4D2 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
4933402E13RikQ9D4D2 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
4933402E13RikQ9D4D2 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
4933402E13RikQ9D4D2 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
4933402E13RikQ9D4D2 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
4933402E13RikQ9D4D2 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
4933402E13RikQ9D4D2 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
4933402E13RikQ9D4D2 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
4933402E13RikQ9D4D2 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
4933402E13RikQ9D4D2 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
4933402E13RikQ9D4D2 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
4933402E13RikQ9D4D2 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
4933402E13RikQ9D4D2 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
4933402E13RikQ9D4D2 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
4933402E13RikQ9D4D2 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
4933402E13RikQ9D4D2 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
4933402E13RikQ9D4D2 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
4933402E13RikQ9D4D2 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
4933402E13RikQ9D4D2 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
4933402E13RikQ9D4D2 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
4933402E13RikQ9D4D2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
4933402E13RikQ9D4D2 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
4933402E13RikQ9D4D2 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
4933402E13RikQ9D4D2 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
4933402E13RikQ9D4D2 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
4933402E13RikQ9D4D2 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
4933402E13RikQ9D4D2 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
4933402E13RikQ9D4D2 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
4933402E13RikQ9D4D2 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
4933402E13RikQ9D4D2 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
4933402E13RikQ9D4D2 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
4933402E13RikQ9D4D2 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
4933402E13RikQ9D4D2 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
4933402E13RikQ9D4D2 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
4933402E13RikQ9D4D2 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
4933402E13RikQ9D4D2 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
4933402E13RikQ9D4D2 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
4933402E13RikQ9D4D2 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
4933402E13RikQ9D4D2 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
4933402E13RikQ9D4D2 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
4933402E13RikQ9D4D2 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
4933402E13RikQ9D4D2 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
4933402E13RikQ9D4D2 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
4933402E13RikQ9D4D2 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
4933402E13RikQ9D4D2 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
4933402E13RikQ9D4D2 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
4933402E13RikQ9D4D2 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
4933402E13RikQ9D4D2 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
4933402E13RikQ9D4D2 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
4933402E13RikQ9D4D2 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
4933402E13RikQ9D4D2 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
4933402E13RikQ9D4D2 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
4933402E13RikQ9D4D2 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
4933402E13RikQ9D4D2 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
4933402E13RikQ9D4D2 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
4933402E13RikQ9D4D2 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
4933402E13RikQ9D4D2 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
4933402E13RikQ9D4D2 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
4933402E13RikQ9D4D2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
4933402E13RikQ9D4D2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms