Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2A5

Creb3l4, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Creb3l4Q9D2A5 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Creb3l4Q9D2A5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Creb3l4Q9D2A5 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Creb3l4Q9D2A5 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Creb3l4Q9D2A5 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Creb3l4Q9D2A5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Creb3l4Q9D2A5 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Creb3l4Q9D2A5 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Creb3l4Q9D2A5 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Creb3l4Q9D2A5 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Creb3l4Q9D2A5 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Creb3l4Q9D2A5 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Creb3l4Q9D2A5 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Creb3l4Q9D2A5 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Creb3l4Q9D2A5 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Creb3l4Q9D2A5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Creb3l4Q9D2A5 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Creb3l4Q9D2A5 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Creb3l4Q9D2A5 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Creb3l4Q9D2A5 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Creb3l4Q9D2A5 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Creb3l4Q9D2A5 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Creb3l4Q9D2A5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Creb3l4Q9D2A5 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Creb3l4Q9D2A5 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Creb3l4Q9D2A5 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Creb3l4Q9D2A5 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Creb3l4Q9D2A5 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Creb3l4Q9D2A5 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Creb3l4Q9D2A5 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Creb3l4Q9D2A5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Creb3l4Q9D2A5 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Creb3l4Q9D2A5 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Creb3l4Q9D2A5 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Creb3l4Q9D2A5 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Creb3l4Q9D2A5 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Creb3l4Q9D2A5 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Creb3l4Q9D2A5 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Creb3l4Q9D2A5 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Creb3l4Q9D2A5 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Creb3l4Q9D2A5 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Creb3l4Q9D2A5 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Creb3l4Q9D2A5 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Creb3l4Q9D2A5 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Creb3l4Q9D2A5 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Creb3l4Q9D2A5 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Creb3l4Q9D2A5 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Creb3l4Q9D2A5 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Creb3l4Q9D2A5 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Creb3l4Q9D2A5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Creb3l4Q9D2A5 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Creb3l4Q9D2A5 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Creb3l4Q9D2A5 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Creb3l4Q9D2A5 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Creb3l4Q9D2A5 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Creb3l4Q9D2A5 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Creb3l4Q9D2A5 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Creb3l4Q9D2A5 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Creb3l4Q9D2A5 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Creb3l4Q9D2A5 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Creb3l4Q9D2A5 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Creb3l4Q9D2A5 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Creb3l4Q9D2A5 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Creb3l4Q9D2A5 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Creb3l4Q9D2A5 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Creb3l4Q9D2A5 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Creb3l4Q9D2A5 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Creb3l4Q9D2A5 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Creb3l4Q9D2A5 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Creb3l4Q9D2A5 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Creb3l4Q9D2A5 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Creb3l4Q9D2A5 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Creb3l4Q9D2A5 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Creb3l4Q9D2A5 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Creb3l4Q9D2A5 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Creb3l4Q9D2A5 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Creb3l4Q9D2A5 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Creb3l4Q9D2A5 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Creb3l4Q9D2A5 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Creb3l4Q9D2A5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Creb3l4Q9D2A5 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Creb3l4Q9D2A5 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Creb3l4Q9D2A5 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Creb3l4Q9D2A5 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Creb3l4Q9D2A5 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Creb3l4Q9D2A5 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Creb3l4Q9D2A5 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Creb3l4Q9D2A5 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Creb3l4Q9D2A5 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Creb3l4Q9D2A5 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Creb3l4Q9D2A5 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Creb3l4Q9D2A5 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Creb3l4Q9D2A5 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Creb3l4Q9D2A5 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Creb3l4Q9D2A5 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Creb3l4Q9D2A5 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Creb3l4Q9D2A5 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Creb3l4Q9D2A5 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Creb3l4Q9D2A5 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Creb3l4Q9D2A5 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms