Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1H6

Ndufaf4, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufaf4Q9D1H6 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ndufaf4Q9D1H6 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Ndufaf4Q9D1H6 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ndufaf4Q9D1H6 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ndufaf4Q9D1H6 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ndufaf4Q9D1H6 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ndufaf4Q9D1H6 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ndufaf4Q9D1H6 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ndufaf4Q9D1H6 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ndufaf4Q9D1H6 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ndufaf4Q9D1H6 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ndufaf4Q9D1H6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ndufaf4Q9D1H6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ndufaf4Q9D1H6 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ndufaf4Q9D1H6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ndufaf4Q9D1H6 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ndufaf4Q9D1H6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ndufaf4Q9D1H6 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ndufaf4Q9D1H6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ndufaf4Q9D1H6 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ndufaf4Q9D1H6 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ndufaf4Q9D1H6 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ndufaf4Q9D1H6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ndufaf4Q9D1H6 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ndufaf4Q9D1H6 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ndufaf4Q9D1H6 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ndufaf4Q9D1H6 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ndufaf4Q9D1H6 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ndufaf4Q9D1H6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ndufaf4Q9D1H6 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ndufaf4Q9D1H6 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ndufaf4Q9D1H6 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ndufaf4Q9D1H6 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ndufaf4Q9D1H6 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ndufaf4Q9D1H6 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ndufaf4Q9D1H6 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ndufaf4Q9D1H6 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ndufaf4Q9D1H6 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ndufaf4Q9D1H6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ndufaf4Q9D1H6 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ndufaf4Q9D1H6 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ndufaf4Q9D1H6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ndufaf4Q9D1H6 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ndufaf4Q9D1H6 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ndufaf4Q9D1H6 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ndufaf4Q9D1H6 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ndufaf4Q9D1H6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ndufaf4Q9D1H6 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ndufaf4Q9D1H6 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ndufaf4Q9D1H6 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ndufaf4Q9D1H6 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ndufaf4Q9D1H6 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ndufaf4Q9D1H6 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ndufaf4Q9D1H6 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ndufaf4Q9D1H6 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ndufaf4Q9D1H6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ndufaf4Q9D1H6 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ndufaf4Q9D1H6 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ndufaf4Q9D1H6 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ndufaf4Q9D1H6 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ndufaf4Q9D1H6 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ndufaf4Q9D1H6 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ndufaf4Q9D1H6 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ndufaf4Q9D1H6 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ndufaf4Q9D1H6 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ndufaf4Q9D1H6 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ndufaf4Q9D1H6 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ndufaf4Q9D1H6 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ndufaf4Q9D1H6 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ndufaf4Q9D1H6 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ndufaf4Q9D1H6 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ndufaf4Q9D1H6 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ndufaf4Q9D1H6 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ndufaf4Q9D1H6 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ndufaf4Q9D1H6 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ndufaf4Q9D1H6 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ndufaf4Q9D1H6 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ndufaf4Q9D1H6 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ndufaf4Q9D1H6 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ndufaf4Q9D1H6 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ndufaf4Q9D1H6 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ndufaf4Q9D1H6 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ndufaf4Q9D1H6 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ndufaf4Q9D1H6 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ndufaf4Q9D1H6 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ndufaf4Q9D1H6 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ndufaf4Q9D1H6 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ndufaf4Q9D1H6 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ndufaf4Q9D1H6 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ndufaf4Q9D1H6 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ndufaf4Q9D1H6 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Ndufaf4Q9D1H6 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Ndufaf4Q9D1H6 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ndufaf4Q9D1H6 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ndufaf4Q9D1H6 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ndufaf4Q9D1H6 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ndufaf4Q9D1H6 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ndufaf4Q9D1H6 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ndufaf4Q9D1H6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ndufaf4Q9D1H6 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 172 ms