Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ44

Nsfl1c, NSFL1 cofactor p47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsfl1cQ9CZ44 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Nsfl1cQ9CZ44 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Nsfl1cQ9CZ44 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Nsfl1cQ9CZ44 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Nsfl1cQ9CZ44 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Nsfl1cQ9CZ44 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Nsfl1cQ9CZ44 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Nsfl1cQ9CZ44 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Nsfl1cQ9CZ44 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Nsfl1cQ9CZ44 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Nsfl1cQ9CZ44 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Nsfl1cQ9CZ44 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Nsfl1cQ9CZ44 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Nsfl1cQ9CZ44 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Nsfl1cQ9CZ44 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Nsfl1cQ9CZ44 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Nsfl1cQ9CZ44 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Nsfl1cQ9CZ44 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Nsfl1cQ9CZ44 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Nsfl1cQ9CZ44 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Nsfl1cQ9CZ44 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Nsfl1cQ9CZ44 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Nsfl1cQ9CZ44 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Nsfl1cQ9CZ44 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Nsfl1cQ9CZ44 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Nsfl1cQ9CZ44 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Nsfl1cQ9CZ44 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Nsfl1cQ9CZ44 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Nsfl1cQ9CZ44 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Nsfl1cQ9CZ44 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Nsfl1cQ9CZ44 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Nsfl1cQ9CZ44 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Nsfl1cQ9CZ44 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Nsfl1cQ9CZ44 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Nsfl1cQ9CZ44 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Nsfl1cQ9CZ44 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Nsfl1cQ9CZ44 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Nsfl1cQ9CZ44 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Nsfl1cQ9CZ44 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Nsfl1cQ9CZ44 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Nsfl1cQ9CZ44 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Nsfl1cQ9CZ44 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Nsfl1cQ9CZ44 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Nsfl1cQ9CZ44 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Nsfl1cQ9CZ44 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Nsfl1cQ9CZ44 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Nsfl1cQ9CZ44 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Nsfl1cQ9CZ44 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Nsfl1cQ9CZ44 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Nsfl1cQ9CZ44 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Nsfl1cQ9CZ44 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Nsfl1cQ9CZ44 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Nsfl1cQ9CZ44 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Nsfl1cQ9CZ44 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Nsfl1cQ9CZ44 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Nsfl1cQ9CZ44 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Nsfl1cQ9CZ44 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
Nsfl1cQ9CZ44 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
Nsfl1cQ9CZ44 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Nsfl1cQ9CZ44 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Nsfl1cQ9CZ44 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Nsfl1cQ9CZ44 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Nsfl1cQ9CZ44 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Nsfl1cQ9CZ44 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Nsfl1cQ9CZ44 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Nsfl1cQ9CZ44 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Nsfl1cQ9CZ44 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Nsfl1cQ9CZ44 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Nsfl1cQ9CZ44 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Nsfl1cQ9CZ44 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Nsfl1cQ9CZ44 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Nsfl1cQ9CZ44 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Nsfl1cQ9CZ44 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Nsfl1cQ9CZ44 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Nsfl1cQ9CZ44 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Nsfl1cQ9CZ44 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Nsfl1cQ9CZ44 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Nsfl1cQ9CZ44 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Nsfl1cQ9CZ44 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Nsfl1cQ9CZ44 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Nsfl1cQ9CZ44 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Nsfl1cQ9CZ44 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Nsfl1cQ9CZ44 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Nsfl1cQ9CZ44 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Nsfl1cQ9CZ44 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Nsfl1cQ9CZ44 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Nsfl1cQ9CZ44 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Nsfl1cQ9CZ44 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Nsfl1cQ9CZ44 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Nsfl1cQ9CZ44 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Nsfl1cQ9CZ44 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Nsfl1cQ9CZ44 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Nsfl1cQ9CZ44 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Nsfl1cQ9CZ44 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Nsfl1cQ9CZ44 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Nsfl1cQ9CZ44 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Nsfl1cQ9CZ44 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Nsfl1cQ9CZ44 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Nsfl1cQ9CZ44 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Nsfl1cQ9CZ44 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms