Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRW3

UPF0538 protein C2orf76 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CRW3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Q9CRW3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Q9CRW3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Q9CRW3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Q9CRW3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Q9CRW3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Q9CRW3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Q9CRW3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Q9CRW3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Q9CRW3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Q9CRW3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Q9CRW3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Q9CRW3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Q9CRW3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Q9CRW3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Q9CRW3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Q9CRW3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Q9CRW3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Q9CRW3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Q9CRW3 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Q9CRW3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Q9CRW3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Q9CRW3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Q9CRW3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Q9CRW3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Q9CRW3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Q9CRW3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Q9CRW3 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Q9CRW3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Q9CRW3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Q9CRW3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Q9CRW3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Q9CRW3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Q9CRW3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Q9CRW3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Q9CRW3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Q9CRW3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Q9CRW3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Q9CRW3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Q9CRW3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Q9CRW3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Q9CRW3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Q9CRW3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Q9CRW3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Q9CRW3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Q9CRW3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Q9CRW3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Q9CRW3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Q9CRW3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Q9CRW3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Q9CRW3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Q9CRW3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Q9CRW3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Q9CRW3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Q9CRW3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Q9CRW3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Q9CRW3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Q9CRW3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Q9CRW3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Q9CRW3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Q9CRW3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Q9CRW3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Q9CRW3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Q9CRW3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Q9CRW3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Q9CRW3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Q9CRW3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Q9CRW3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Q9CRW3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Q9CRW3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Q9CRW3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Q9CRW3 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Q9CRW3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Q9CRW3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Q9CRW3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Q9CRW3 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Q9CRW3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Q9CRW3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Q9CRW3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Q9CRW3 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Q9CRW3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Q9CRW3 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Q9CRW3 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Q9CRW3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Q9CRW3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Q9CRW3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Q9CRW3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Q9CRW3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Q9CRW3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Q9CRW3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Q9CRW3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Q9CRW3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Q9CRW3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Q9CRW3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Q9CRW3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Q9CRW3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Q9CRW3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Q9CRW3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Q9CRW3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Q9CRW3 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms