Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQU3

Rer1, Protein RER1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rer1Q9CQU3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rer1Q9CQU3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rer1Q9CQU3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rer1Q9CQU3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rer1Q9CQU3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rer1Q9CQU3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rer1Q9CQU3 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rer1Q9CQU3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rer1Q9CQU3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Rer1Q9CQU3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rer1Q9CQU3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rer1Q9CQU3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rer1Q9CQU3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rer1Q9CQU3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rer1Q9CQU3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rer1Q9CQU3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rer1Q9CQU3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rer1Q9CQU3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rer1Q9CQU3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rer1Q9CQU3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rer1Q9CQU3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rer1Q9CQU3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rer1Q9CQU3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rer1Q9CQU3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rer1Q9CQU3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rer1Q9CQU3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rer1Q9CQU3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rer1Q9CQU3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rer1Q9CQU3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rer1Q9CQU3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rer1Q9CQU3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rer1Q9CQU3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rer1Q9CQU3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rer1Q9CQU3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rer1Q9CQU3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rer1Q9CQU3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rer1Q9CQU3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rer1Q9CQU3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rer1Q9CQU3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rer1Q9CQU3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rer1Q9CQU3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rer1Q9CQU3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rer1Q9CQU3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rer1Q9CQU3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rer1Q9CQU3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rer1Q9CQU3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rer1Q9CQU3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rer1Q9CQU3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rer1Q9CQU3 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rer1Q9CQU3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rer1Q9CQU3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rer1Q9CQU3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rer1Q9CQU3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rer1Q9CQU3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rer1Q9CQU3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rer1Q9CQU3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rer1Q9CQU3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rer1Q9CQU3 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Rer1Q9CQU3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rer1Q9CQU3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rer1Q9CQU3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rer1Q9CQU3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rer1Q9CQU3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rer1Q9CQU3 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rer1Q9CQU3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rer1Q9CQU3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rer1Q9CQU3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rer1Q9CQU3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rer1Q9CQU3 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Rer1Q9CQU3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rer1Q9CQU3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rer1Q9CQU3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rer1Q9CQU3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rer1Q9CQU3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rer1Q9CQU3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Rer1Q9CQU3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rer1Q9CQU3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rer1Q9CQU3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rer1Q9CQU3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rer1Q9CQU3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rer1Q9CQU3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rer1Q9CQU3 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rer1Q9CQU3 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rer1Q9CQU3 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rer1Q9CQU3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rer1Q9CQU3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rer1Q9CQU3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rer1Q9CQU3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rer1Q9CQU3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rer1Q9CQU3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rer1Q9CQU3 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rer1Q9CQU3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Rer1Q9CQU3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rer1Q9CQU3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rer1Q9CQU3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rer1Q9CQU3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rer1Q9CQU3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rer1Q9CQU3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rer1Q9CQU3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rer1Q9CQU3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms