Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQT5

Pomp, Proteasome maturation protein, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PompQ9CQT5 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PompQ9CQT5 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PompQ9CQT5 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PompQ9CQT5 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PompQ9CQT5 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PompQ9CQT5 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PompQ9CQT5 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PompQ9CQT5 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PompQ9CQT5 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PompQ9CQT5 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PompQ9CQT5 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PompQ9CQT5 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PompQ9CQT5 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PompQ9CQT5 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PompQ9CQT5 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PompQ9CQT5 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PompQ9CQT5 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PompQ9CQT5 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PompQ9CQT5 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PompQ9CQT5 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PompQ9CQT5 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PompQ9CQT5 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PompQ9CQT5 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PompQ9CQT5 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PompQ9CQT5 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PompQ9CQT5 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PompQ9CQT5 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PompQ9CQT5 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PompQ9CQT5 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PompQ9CQT5 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PompQ9CQT5 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PompQ9CQT5 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PompQ9CQT5 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PompQ9CQT5 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PompQ9CQT5 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PompQ9CQT5 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PompQ9CQT5 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PompQ9CQT5 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PompQ9CQT5 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PompQ9CQT5 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PompQ9CQT5 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PompQ9CQT5 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PompQ9CQT5 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PompQ9CQT5 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PompQ9CQT5 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PompQ9CQT5 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PompQ9CQT5 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PompQ9CQT5 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PompQ9CQT5 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PompQ9CQT5 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PompQ9CQT5 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PompQ9CQT5 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PompQ9CQT5 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PompQ9CQT5 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PompQ9CQT5 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PompQ9CQT5 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PompQ9CQT5 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PompQ9CQT5 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PompQ9CQT5 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PompQ9CQT5 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PompQ9CQT5 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PompQ9CQT5 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PompQ9CQT5 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PompQ9CQT5 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PompQ9CQT5 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PompQ9CQT5 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PompQ9CQT5 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PompQ9CQT5 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PompQ9CQT5 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PompQ9CQT5 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PompQ9CQT5 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PompQ9CQT5 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PompQ9CQT5 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PompQ9CQT5 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PompQ9CQT5 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PompQ9CQT5 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PompQ9CQT5 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PompQ9CQT5 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PompQ9CQT5 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PompQ9CQT5 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PompQ9CQT5 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PompQ9CQT5 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PompQ9CQT5 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PompQ9CQT5 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PompQ9CQT5 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PompQ9CQT5 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PompQ9CQT5 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PompQ9CQT5 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PompQ9CQT5 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PompQ9CQT5 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PompQ9CQT5 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PompQ9CQT5 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PompQ9CQT5 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PompQ9CQT5 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PompQ9CQT5 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PompQ9CQT5 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PompQ9CQT5 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PompQ9CQT5 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PompQ9CQT5 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PompQ9CQT5 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms