Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD0

Rpl39l, RIKEN cDNA 4930517K11, mousemouse

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Length 51 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl39lQ9CQD0 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpl39lQ9CQD0 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpl39lQ9CQD0 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpl39lQ9CQD0 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpl39lQ9CQD0 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpl39lQ9CQD0 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpl39lQ9CQD0 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpl39lQ9CQD0 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpl39lQ9CQD0 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpl39lQ9CQD0 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpl39lQ9CQD0 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpl39lQ9CQD0 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpl39lQ9CQD0 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpl39lQ9CQD0 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpl39lQ9CQD0 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpl39lQ9CQD0 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpl39lQ9CQD0 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpl39lQ9CQD0 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpl39lQ9CQD0 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rpl39lQ9CQD0 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rpl39lQ9CQD0 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rpl39lQ9CQD0 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rpl39lQ9CQD0 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rpl39lQ9CQD0 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rpl39lQ9CQD0 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rpl39lQ9CQD0 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rpl39lQ9CQD0 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rpl39lQ9CQD0 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rpl39lQ9CQD0 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpl39lQ9CQD0 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpl39lQ9CQD0 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpl39lQ9CQD0 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpl39lQ9CQD0 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpl39lQ9CQD0 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpl39lQ9CQD0 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpl39lQ9CQD0 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpl39lQ9CQD0 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpl39lQ9CQD0 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpl39lQ9CQD0 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpl39lQ9CQD0 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpl39lQ9CQD0 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpl39lQ9CQD0 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rpl39lQ9CQD0 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rpl39lQ9CQD0 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rpl39lQ9CQD0 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rpl39lQ9CQD0 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rpl39lQ9CQD0 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rpl39lQ9CQD0 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rpl39lQ9CQD0 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rpl39lQ9CQD0 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rpl39lQ9CQD0 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rpl39lQ9CQD0 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rpl39lQ9CQD0 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rpl39lQ9CQD0 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rpl39lQ9CQD0 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rpl39lQ9CQD0 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rpl39lQ9CQD0 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rpl39lQ9CQD0 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rpl39lQ9CQD0 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rpl39lQ9CQD0 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Rpl39lQ9CQD0 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpl39lQ9CQD0 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Rpl39lQ9CQD0 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Rpl39lQ9CQD0 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpl39lQ9CQD0 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpl39lQ9CQD0 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpl39lQ9CQD0 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Rpl39lQ9CQD0 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpl39lQ9CQD0 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpl39lQ9CQD0 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpl39lQ9CQD0 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpl39lQ9CQD0 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpl39lQ9CQD0 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpl39lQ9CQD0 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpl39lQ9CQD0 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpl39lQ9CQD0 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpl39lQ9CQD0 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpl39lQ9CQD0 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpl39lQ9CQD0 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpl39lQ9CQD0 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpl39lQ9CQD0 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpl39lQ9CQD0 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpl39lQ9CQD0 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpl39lQ9CQD0 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpl39lQ9CQD0 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpl39lQ9CQD0 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpl39lQ9CQD0 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rpl39lQ9CQD0 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpl39lQ9CQD0 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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