Protein–RNA interactions for Protein: Q99PT3

Ino80b, INO80 complex subunit B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80bQ99PT3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ino80bQ99PT3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ino80bQ99PT3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ino80bQ99PT3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ino80bQ99PT3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ino80bQ99PT3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ino80bQ99PT3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ino80bQ99PT3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ino80bQ99PT3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ino80bQ99PT3 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ino80bQ99PT3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ino80bQ99PT3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ino80bQ99PT3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Ino80bQ99PT3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ino80bQ99PT3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ino80bQ99PT3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ino80bQ99PT3 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ino80bQ99PT3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ino80bQ99PT3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ino80bQ99PT3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ino80bQ99PT3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ino80bQ99PT3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ino80bQ99PT3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ino80bQ99PT3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ino80bQ99PT3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ino80bQ99PT3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ino80bQ99PT3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ino80bQ99PT3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ino80bQ99PT3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ino80bQ99PT3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ino80bQ99PT3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ino80bQ99PT3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ino80bQ99PT3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ino80bQ99PT3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ino80bQ99PT3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ino80bQ99PT3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ino80bQ99PT3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ino80bQ99PT3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ino80bQ99PT3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ino80bQ99PT3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ino80bQ99PT3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ino80bQ99PT3 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ino80bQ99PT3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ino80bQ99PT3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ino80bQ99PT3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ino80bQ99PT3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ino80bQ99PT3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ino80bQ99PT3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ino80bQ99PT3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ino80bQ99PT3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ino80bQ99PT3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ino80bQ99PT3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ino80bQ99PT3 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ino80bQ99PT3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ino80bQ99PT3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Ino80bQ99PT3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ino80bQ99PT3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ino80bQ99PT3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ino80bQ99PT3 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ino80bQ99PT3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ino80bQ99PT3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ino80bQ99PT3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ino80bQ99PT3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ino80bQ99PT3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ino80bQ99PT3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ino80bQ99PT3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ino80bQ99PT3 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ino80bQ99PT3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Ino80bQ99PT3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ino80bQ99PT3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ino80bQ99PT3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ino80bQ99PT3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ino80bQ99PT3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ino80bQ99PT3 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ino80bQ99PT3 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Ino80bQ99PT3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ino80bQ99PT3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ino80bQ99PT3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ino80bQ99PT3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ino80bQ99PT3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ino80bQ99PT3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ino80bQ99PT3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ino80bQ99PT3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ino80bQ99PT3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ino80bQ99PT3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ino80bQ99PT3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ino80bQ99PT3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Ino80bQ99PT3 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Ino80bQ99PT3 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Ino80bQ99PT3 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Ino80bQ99PT3 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ino80bQ99PT3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ino80bQ99PT3 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ino80bQ99PT3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ino80bQ99PT3 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ino80bQ99PT3 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Ino80bQ99PT3 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Ino80bQ99PT3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ino80bQ99PT3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ino80bQ99PT3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms