Protein–RNA interactions for Protein: Q99PI4

Lpin3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lpin3Q99PI4 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lpin3Q99PI4 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lpin3Q99PI4 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lpin3Q99PI4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lpin3Q99PI4 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Lpin3Q99PI4 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Lpin3Q99PI4 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Lpin3Q99PI4 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lpin3Q99PI4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lpin3Q99PI4 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lpin3Q99PI4 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Lpin3Q99PI4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lpin3Q99PI4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lpin3Q99PI4 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lpin3Q99PI4 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lpin3Q99PI4 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lpin3Q99PI4 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lpin3Q99PI4 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Lpin3Q99PI4 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lpin3Q99PI4 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lpin3Q99PI4 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Lpin3Q99PI4 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lpin3Q99PI4 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lpin3Q99PI4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lpin3Q99PI4 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lpin3Q99PI4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lpin3Q99PI4 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lpin3Q99PI4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lpin3Q99PI4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lpin3Q99PI4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lpin3Q99PI4 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lpin3Q99PI4 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lpin3Q99PI4 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lpin3Q99PI4 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lpin3Q99PI4 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lpin3Q99PI4 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lpin3Q99PI4 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lpin3Q99PI4 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lpin3Q99PI4 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lpin3Q99PI4 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lpin3Q99PI4 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lpin3Q99PI4 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lpin3Q99PI4 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lpin3Q99PI4 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lpin3Q99PI4 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lpin3Q99PI4 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lpin3Q99PI4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lpin3Q99PI4 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lpin3Q99PI4 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lpin3Q99PI4 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lpin3Q99PI4 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lpin3Q99PI4 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lpin3Q99PI4 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lpin3Q99PI4 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lpin3Q99PI4 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lpin3Q99PI4 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lpin3Q99PI4 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lpin3Q99PI4 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lpin3Q99PI4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lpin3Q99PI4 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lpin3Q99PI4 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lpin3Q99PI4 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lpin3Q99PI4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Lpin3Q99PI4 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lpin3Q99PI4 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lpin3Q99PI4 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lpin3Q99PI4 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lpin3Q99PI4 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lpin3Q99PI4 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lpin3Q99PI4 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lpin3Q99PI4 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lpin3Q99PI4 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lpin3Q99PI4 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lpin3Q99PI4 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lpin3Q99PI4 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lpin3Q99PI4 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lpin3Q99PI4 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lpin3Q99PI4 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lpin3Q99PI4 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lpin3Q99PI4 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lpin3Q99PI4 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lpin3Q99PI4 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lpin3Q99PI4 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lpin3Q99PI4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lpin3Q99PI4 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lpin3Q99PI4 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lpin3Q99PI4 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lpin3Q99PI4 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lpin3Q99PI4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lpin3Q99PI4 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lpin3Q99PI4 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lpin3Q99PI4 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lpin3Q99PI4 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lpin3Q99PI4 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lpin3Q99PI4 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Lpin3Q99PI4 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lpin3Q99PI4 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lpin3Q99PI4 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lpin3Q99PI4 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lpin3Q99PI4 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.9 ms