Protein–RNA interactions for Protein: Q99P69

Nuf2, Kinetochore protein Nuf2, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nuf2Q99P69 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nuf2Q99P69 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nuf2Q99P69 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nuf2Q99P69 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nuf2Q99P69 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nuf2Q99P69 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nuf2Q99P69 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nuf2Q99P69 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nuf2Q99P69 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nuf2Q99P69 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nuf2Q99P69 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nuf2Q99P69 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nuf2Q99P69 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nuf2Q99P69 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nuf2Q99P69 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Nuf2Q99P69 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nuf2Q99P69 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nuf2Q99P69 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nuf2Q99P69 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nuf2Q99P69 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nuf2Q99P69 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nuf2Q99P69 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nuf2Q99P69 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nuf2Q99P69 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nuf2Q99P69 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nuf2Q99P69 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nuf2Q99P69 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nuf2Q99P69 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nuf2Q99P69 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nuf2Q99P69 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nuf2Q99P69 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nuf2Q99P69 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nuf2Q99P69 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nuf2Q99P69 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nuf2Q99P69 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nuf2Q99P69 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nuf2Q99P69 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nuf2Q99P69 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nuf2Q99P69 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nuf2Q99P69 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nuf2Q99P69 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nuf2Q99P69 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nuf2Q99P69 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nuf2Q99P69 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nuf2Q99P69 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nuf2Q99P69 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nuf2Q99P69 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nuf2Q99P69 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nuf2Q99P69 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nuf2Q99P69 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nuf2Q99P69 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nuf2Q99P69 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nuf2Q99P69 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nuf2Q99P69 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nuf2Q99P69 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nuf2Q99P69 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nuf2Q99P69 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nuf2Q99P69 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nuf2Q99P69 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nuf2Q99P69 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nuf2Q99P69 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nuf2Q99P69 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nuf2Q99P69 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nuf2Q99P69 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nuf2Q99P69 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nuf2Q99P69 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nuf2Q99P69 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nuf2Q99P69 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nuf2Q99P69 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nuf2Q99P69 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nuf2Q99P69 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nuf2Q99P69 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nuf2Q99P69 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nuf2Q99P69 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Nuf2Q99P69 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nuf2Q99P69 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Nuf2Q99P69 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Nuf2Q99P69 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nuf2Q99P69 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nuf2Q99P69 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Nuf2Q99P69 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nuf2Q99P69 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Nuf2Q99P69 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nuf2Q99P69 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Nuf2Q99P69 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nuf2Q99P69 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nuf2Q99P69 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nuf2Q99P69 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.3■■□□□ 1
Nuf2Q99P69 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nuf2Q99P69 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nuf2Q99P69 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nuf2Q99P69 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Nuf2Q99P69 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nuf2Q99P69 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nuf2Q99P69 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nuf2Q99P69 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nuf2Q99P69 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nuf2Q99P69 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.28■■□□□ 1
Nuf2Q99P69 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nuf2Q99P69 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms