Protein–RNA interactions for Protein: Q99MS8

Tpgs1, Tubulin polyglutamylase complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpgs1Q99MS8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tpgs1Q99MS8 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tpgs1Q99MS8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tpgs1Q99MS8 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tpgs1Q99MS8 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tpgs1Q99MS8 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tpgs1Q99MS8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tpgs1Q99MS8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tpgs1Q99MS8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tpgs1Q99MS8 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tpgs1Q99MS8 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tpgs1Q99MS8 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tpgs1Q99MS8 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tpgs1Q99MS8 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tpgs1Q99MS8 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tpgs1Q99MS8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tpgs1Q99MS8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tpgs1Q99MS8 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tpgs1Q99MS8 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tpgs1Q99MS8 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tpgs1Q99MS8 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tpgs1Q99MS8 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tpgs1Q99MS8 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tpgs1Q99MS8 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tpgs1Q99MS8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tpgs1Q99MS8 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tpgs1Q99MS8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tpgs1Q99MS8 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Tpgs1Q99MS8 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Tpgs1Q99MS8 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Tpgs1Q99MS8 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tpgs1Q99MS8 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tpgs1Q99MS8 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tpgs1Q99MS8 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tpgs1Q99MS8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tpgs1Q99MS8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tpgs1Q99MS8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tpgs1Q99MS8 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tpgs1Q99MS8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tpgs1Q99MS8 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tpgs1Q99MS8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tpgs1Q99MS8 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tpgs1Q99MS8 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tpgs1Q99MS8 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tpgs1Q99MS8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tpgs1Q99MS8 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Tpgs1Q99MS8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tpgs1Q99MS8 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tpgs1Q99MS8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Tpgs1Q99MS8 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tpgs1Q99MS8 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tpgs1Q99MS8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tpgs1Q99MS8 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tpgs1Q99MS8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tpgs1Q99MS8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tpgs1Q99MS8 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tpgs1Q99MS8 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tpgs1Q99MS8 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tpgs1Q99MS8 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tpgs1Q99MS8 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tpgs1Q99MS8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tpgs1Q99MS8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tpgs1Q99MS8 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tpgs1Q99MS8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tpgs1Q99MS8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tpgs1Q99MS8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tpgs1Q99MS8 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Tpgs1Q99MS8 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tpgs1Q99MS8 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Tpgs1Q99MS8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tpgs1Q99MS8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
Tpgs1Q99MS8 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tpgs1Q99MS8 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tpgs1Q99MS8 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Tpgs1Q99MS8 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tpgs1Q99MS8 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tpgs1Q99MS8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tpgs1Q99MS8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tpgs1Q99MS8 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tpgs1Q99MS8 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tpgs1Q99MS8 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tpgs1Q99MS8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tpgs1Q99MS8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tpgs1Q99MS8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tpgs1Q99MS8 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tpgs1Q99MS8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tpgs1Q99MS8 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tpgs1Q99MS8 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tpgs1Q99MS8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tpgs1Q99MS8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tpgs1Q99MS8 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Tpgs1Q99MS8 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tpgs1Q99MS8 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tpgs1Q99MS8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tpgs1Q99MS8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tpgs1Q99MS8 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tpgs1Q99MS8 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tpgs1Q99MS8 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tpgs1Q99MS8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tpgs1Q99MS8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 134.4 ms