Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SrrtQ99MR6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SrrtQ99MR6 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SrrtQ99MR6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SrrtQ99MR6 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SrrtQ99MR6 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SrrtQ99MR6 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SrrtQ99MR6 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SrrtQ99MR6 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SrrtQ99MR6 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SrrtQ99MR6 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SrrtQ99MR6 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SrrtQ99MR6 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SrrtQ99MR6 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SrrtQ99MR6 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SrrtQ99MR6 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SrrtQ99MR6 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SrrtQ99MR6 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SrrtQ99MR6 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SrrtQ99MR6 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SrrtQ99MR6 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SrrtQ99MR6 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SrrtQ99MR6 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SrrtQ99MR6 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SrrtQ99MR6 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SrrtQ99MR6 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
SrrtQ99MR6 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SrrtQ99MR6 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SrrtQ99MR6 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SrrtQ99MR6 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SrrtQ99MR6 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SrrtQ99MR6 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
SrrtQ99MR6 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SrrtQ99MR6 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SrrtQ99MR6 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SrrtQ99MR6 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SrrtQ99MR6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
SrrtQ99MR6 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SrrtQ99MR6 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SrrtQ99MR6 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SrrtQ99MR6 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SrrtQ99MR6 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SrrtQ99MR6 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SrrtQ99MR6 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SrrtQ99MR6 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SrrtQ99MR6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SrrtQ99MR6 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SrrtQ99MR6 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SrrtQ99MR6 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SrrtQ99MR6 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SrrtQ99MR6 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SrrtQ99MR6 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SrrtQ99MR6 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SrrtQ99MR6 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SrrtQ99MR6 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SrrtQ99MR6 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SrrtQ99MR6 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SrrtQ99MR6 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SrrtQ99MR6 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SrrtQ99MR6 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SrrtQ99MR6 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SrrtQ99MR6 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SrrtQ99MR6 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SrrtQ99MR6 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SrrtQ99MR6 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SrrtQ99MR6 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SrrtQ99MR6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SrrtQ99MR6 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SrrtQ99MR6 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SrrtQ99MR6 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SrrtQ99MR6 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SrrtQ99MR6 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SrrtQ99MR6 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SrrtQ99MR6 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SrrtQ99MR6 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SrrtQ99MR6 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SrrtQ99MR6 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SrrtQ99MR6 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SrrtQ99MR6 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SrrtQ99MR6 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SrrtQ99MR6 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SrrtQ99MR6 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SrrtQ99MR6 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SrrtQ99MR6 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SrrtQ99MR6 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SrrtQ99MR6 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SrrtQ99MR6 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SrrtQ99MR6 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SrrtQ99MR6 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SrrtQ99MR6 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SrrtQ99MR6 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SrrtQ99MR6 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SrrtQ99MR6 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SrrtQ99MR6 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SrrtQ99MR6 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SrrtQ99MR6 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SrrtQ99MR6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SrrtQ99MR6 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SrrtQ99MR6 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SrrtQ99MR6 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms