Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR3

Slc12a9, Solute carrier family 12 member 9, mousemouse

Predictions only

Length 914 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc12a9Q99MR3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Slc12a9Q99MR3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Slc12a9Q99MR3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Slc12a9Q99MR3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Slc12a9Q99MR3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Slc12a9Q99MR3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Slc12a9Q99MR3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Slc12a9Q99MR3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Slc12a9Q99MR3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Slc12a9Q99MR3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Slc12a9Q99MR3 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Slc12a9Q99MR3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Slc12a9Q99MR3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Slc12a9Q99MR3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Slc12a9Q99MR3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Slc12a9Q99MR3 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Slc12a9Q99MR3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Slc12a9Q99MR3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Slc12a9Q99MR3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Slc12a9Q99MR3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Slc12a9Q99MR3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Slc12a9Q99MR3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Slc12a9Q99MR3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Slc12a9Q99MR3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Slc12a9Q99MR3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Slc12a9Q99MR3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Slc12a9Q99MR3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Slc12a9Q99MR3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Slc12a9Q99MR3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Slc12a9Q99MR3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Slc12a9Q99MR3 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Slc12a9Q99MR3 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Slc12a9Q99MR3 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Slc12a9Q99MR3 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Slc12a9Q99MR3 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Slc12a9Q99MR3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Slc12a9Q99MR3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Slc12a9Q99MR3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Slc12a9Q99MR3 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Slc12a9Q99MR3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Slc12a9Q99MR3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Slc12a9Q99MR3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Slc12a9Q99MR3 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Slc12a9Q99MR3 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Slc12a9Q99MR3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Slc12a9Q99MR3 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Slc12a9Q99MR3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Slc12a9Q99MR3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Slc12a9Q99MR3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Slc12a9Q99MR3 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Slc12a9Q99MR3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Slc12a9Q99MR3 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Slc12a9Q99MR3 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Slc12a9Q99MR3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Slc12a9Q99MR3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Slc12a9Q99MR3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Slc12a9Q99MR3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Slc12a9Q99MR3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Slc12a9Q99MR3 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Slc12a9Q99MR3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Slc12a9Q99MR3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Slc12a9Q99MR3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Slc12a9Q99MR3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Slc12a9Q99MR3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Slc12a9Q99MR3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Slc12a9Q99MR3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Slc12a9Q99MR3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Slc12a9Q99MR3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Slc12a9Q99MR3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Slc12a9Q99MR3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Slc12a9Q99MR3 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Slc12a9Q99MR3 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Slc12a9Q99MR3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Slc12a9Q99MR3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Slc12a9Q99MR3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Slc12a9Q99MR3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Slc12a9Q99MR3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Slc12a9Q99MR3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Slc12a9Q99MR3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Slc12a9Q99MR3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Slc12a9Q99MR3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Slc12a9Q99MR3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Slc12a9Q99MR3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Slc12a9Q99MR3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Slc12a9Q99MR3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Slc12a9Q99MR3 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Slc12a9Q99MR3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Slc12a9Q99MR3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Slc12a9Q99MR3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Slc12a9Q99MR3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Slc12a9Q99MR3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Slc12a9Q99MR3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Slc12a9Q99MR3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Slc12a9Q99MR3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Slc12a9Q99MR3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Slc12a9Q99MR3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Slc12a9Q99MR3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Slc12a9Q99MR3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Slc12a9Q99MR3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Slc12a9Q99MR3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms