Protein–RNA interactions for Protein: Q99MP3

Calcb, Calcitonin gene-related peptide 2, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CalcbQ99MP3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CalcbQ99MP3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CalcbQ99MP3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CalcbQ99MP3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CalcbQ99MP3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CalcbQ99MP3 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CalcbQ99MP3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CalcbQ99MP3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CalcbQ99MP3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CalcbQ99MP3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CalcbQ99MP3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CalcbQ99MP3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CalcbQ99MP3 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CalcbQ99MP3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CalcbQ99MP3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CalcbQ99MP3 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CalcbQ99MP3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CalcbQ99MP3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CalcbQ99MP3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CalcbQ99MP3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CalcbQ99MP3 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CalcbQ99MP3 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CalcbQ99MP3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CalcbQ99MP3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CalcbQ99MP3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CalcbQ99MP3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CalcbQ99MP3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CalcbQ99MP3 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CalcbQ99MP3 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CalcbQ99MP3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CalcbQ99MP3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CalcbQ99MP3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CalcbQ99MP3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CalcbQ99MP3 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CalcbQ99MP3 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CalcbQ99MP3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CalcbQ99MP3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CalcbQ99MP3 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
CalcbQ99MP3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CalcbQ99MP3 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CalcbQ99MP3 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CalcbQ99MP3 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CalcbQ99MP3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CalcbQ99MP3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CalcbQ99MP3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CalcbQ99MP3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CalcbQ99MP3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CalcbQ99MP3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CalcbQ99MP3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CalcbQ99MP3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CalcbQ99MP3 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CalcbQ99MP3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CalcbQ99MP3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CalcbQ99MP3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CalcbQ99MP3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CalcbQ99MP3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CalcbQ99MP3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CalcbQ99MP3 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CalcbQ99MP3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CalcbQ99MP3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CalcbQ99MP3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CalcbQ99MP3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CalcbQ99MP3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CalcbQ99MP3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CalcbQ99MP3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CalcbQ99MP3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CalcbQ99MP3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CalcbQ99MP3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CalcbQ99MP3 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CalcbQ99MP3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CalcbQ99MP3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CalcbQ99MP3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CalcbQ99MP3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CalcbQ99MP3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CalcbQ99MP3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CalcbQ99MP3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CalcbQ99MP3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CalcbQ99MP3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CalcbQ99MP3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CalcbQ99MP3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CalcbQ99MP3 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CalcbQ99MP3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CalcbQ99MP3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CalcbQ99MP3 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CalcbQ99MP3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CalcbQ99MP3 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CalcbQ99MP3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CalcbQ99MP3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CalcbQ99MP3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CalcbQ99MP3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CalcbQ99MP3 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CalcbQ99MP3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CalcbQ99MP3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CalcbQ99MP3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CalcbQ99MP3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CalcbQ99MP3 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CalcbQ99MP3 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CalcbQ99MP3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CalcbQ99MP3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CalcbQ99MP3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 181.7 ms