Protein–RNA interactions for Protein: Q99JI4

Psmd6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd6Q99JI4 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Psmd6Q99JI4 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Psmd6Q99JI4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Psmd6Q99JI4 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Psmd6Q99JI4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Psmd6Q99JI4 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Psmd6Q99JI4 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Psmd6Q99JI4 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Psmd6Q99JI4 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Psmd6Q99JI4 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Psmd6Q99JI4 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Psmd6Q99JI4 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Psmd6Q99JI4 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Psmd6Q99JI4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Psmd6Q99JI4 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Psmd6Q99JI4 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Psmd6Q99JI4 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Psmd6Q99JI4 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Psmd6Q99JI4 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Psmd6Q99JI4 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Psmd6Q99JI4 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Psmd6Q99JI4 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Psmd6Q99JI4 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Psmd6Q99JI4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Psmd6Q99JI4 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Psmd6Q99JI4 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Psmd6Q99JI4 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Psmd6Q99JI4 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Psmd6Q99JI4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Psmd6Q99JI4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Psmd6Q99JI4 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Psmd6Q99JI4 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Psmd6Q99JI4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Psmd6Q99JI4 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Psmd6Q99JI4 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Psmd6Q99JI4 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Psmd6Q99JI4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Psmd6Q99JI4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Psmd6Q99JI4 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Psmd6Q99JI4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Psmd6Q99JI4 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Psmd6Q99JI4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Psmd6Q99JI4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Psmd6Q99JI4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Psmd6Q99JI4 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Psmd6Q99JI4 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Psmd6Q99JI4 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Psmd6Q99JI4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Psmd6Q99JI4 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Psmd6Q99JI4 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Psmd6Q99JI4 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Psmd6Q99JI4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Psmd6Q99JI4 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Psmd6Q99JI4 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Psmd6Q99JI4 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Psmd6Q99JI4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Psmd6Q99JI4 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Psmd6Q99JI4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Psmd6Q99JI4 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Psmd6Q99JI4 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Psmd6Q99JI4 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Psmd6Q99JI4 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Psmd6Q99JI4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Psmd6Q99JI4 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Psmd6Q99JI4 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Psmd6Q99JI4 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Psmd6Q99JI4 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Psmd6Q99JI4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Psmd6Q99JI4 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Psmd6Q99JI4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Psmd6Q99JI4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Psmd6Q99JI4 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Psmd6Q99JI4 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Psmd6Q99JI4 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Psmd6Q99JI4 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Psmd6Q99JI4 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Psmd6Q99JI4 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Psmd6Q99JI4 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Psmd6Q99JI4 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Psmd6Q99JI4 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Psmd6Q99JI4 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Psmd6Q99JI4 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Psmd6Q99JI4 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Psmd6Q99JI4 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Psmd6Q99JI4 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Psmd6Q99JI4 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Psmd6Q99JI4 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Psmd6Q99JI4 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Psmd6Q99JI4 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Psmd6Q99JI4 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Psmd6Q99JI4 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Psmd6Q99JI4 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Psmd6Q99JI4 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Psmd6Q99JI4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Psmd6Q99JI4 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Psmd6Q99JI4 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Psmd6Q99JI4 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Psmd6Q99JI4 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Psmd6Q99JI4 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Psmd6Q99JI4 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms