Protein–RNA interactions for Protein: Q99J87

Dhx58, Probable ATP-dependent RNA helicase DHX58, mousemouse

Predictions only

Length 678 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dhx58Q99J87 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Dhx58Q99J87 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Dhx58Q99J87 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Dhx58Q99J87 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Dhx58Q99J87 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Dhx58Q99J87 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Dhx58Q99J87 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Dhx58Q99J87 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Dhx58Q99J87 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Dhx58Q99J87 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Dhx58Q99J87 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Dhx58Q99J87 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Dhx58Q99J87 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Dhx58Q99J87 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Dhx58Q99J87 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Dhx58Q99J87 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Dhx58Q99J87 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Dhx58Q99J87 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Dhx58Q99J87 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Dhx58Q99J87 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Dhx58Q99J87 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Dhx58Q99J87 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Dhx58Q99J87 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Dhx58Q99J87 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Dhx58Q99J87 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Dhx58Q99J87 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Dhx58Q99J87 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Dhx58Q99J87 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Dhx58Q99J87 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Dhx58Q99J87 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Dhx58Q99J87 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Dhx58Q99J87 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Dhx58Q99J87 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Dhx58Q99J87 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Dhx58Q99J87 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Dhx58Q99J87 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Dhx58Q99J87 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Dhx58Q99J87 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Dhx58Q99J87 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Dhx58Q99J87 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Dhx58Q99J87 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Dhx58Q99J87 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Dhx58Q99J87 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Dhx58Q99J87 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Dhx58Q99J87 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Dhx58Q99J87 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Dhx58Q99J87 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Dhx58Q99J87 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Dhx58Q99J87 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Dhx58Q99J87 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Dhx58Q99J87 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Dhx58Q99J87 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Dhx58Q99J87 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Dhx58Q99J87 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Dhx58Q99J87 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Dhx58Q99J87 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Dhx58Q99J87 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Dhx58Q99J87 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Dhx58Q99J87 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Dhx58Q99J87 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Dhx58Q99J87 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Dhx58Q99J87 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Dhx58Q99J87 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Dhx58Q99J87 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Dhx58Q99J87 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Dhx58Q99J87 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Dhx58Q99J87 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Dhx58Q99J87 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Dhx58Q99J87 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Dhx58Q99J87 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Dhx58Q99J87 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Dhx58Q99J87 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Dhx58Q99J87 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Dhx58Q99J87 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Dhx58Q99J87 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Dhx58Q99J87 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Dhx58Q99J87 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Dhx58Q99J87 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Dhx58Q99J87 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Dhx58Q99J87 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Dhx58Q99J87 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Dhx58Q99J87 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Dhx58Q99J87 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Dhx58Q99J87 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Dhx58Q99J87 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Dhx58Q99J87 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Dhx58Q99J87 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Dhx58Q99J87 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Dhx58Q99J87 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Dhx58Q99J87 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Dhx58Q99J87 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Dhx58Q99J87 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Dhx58Q99J87 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Dhx58Q99J87 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Dhx58Q99J87 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Dhx58Q99J87 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Dhx58Q99J87 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Dhx58Q99J87 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Dhx58Q99J87 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Dhx58Q99J87 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.4 ms