Protein–RNA interactions for Protein: Q920A7

Afg3l1, AFG3-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 789 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l1Q920A7 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Afg3l1Q920A7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Afg3l1Q920A7 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Afg3l1Q920A7 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Afg3l1Q920A7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Afg3l1Q920A7 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Afg3l1Q920A7 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Afg3l1Q920A7 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Afg3l1Q920A7 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Afg3l1Q920A7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Afg3l1Q920A7 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Afg3l1Q920A7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Afg3l1Q920A7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Afg3l1Q920A7 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Afg3l1Q920A7 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Afg3l1Q920A7 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Afg3l1Q920A7 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Afg3l1Q920A7 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Afg3l1Q920A7 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Afg3l1Q920A7 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Afg3l1Q920A7 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Afg3l1Q920A7 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Afg3l1Q920A7 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Afg3l1Q920A7 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Afg3l1Q920A7 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Afg3l1Q920A7 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Afg3l1Q920A7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Afg3l1Q920A7 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Afg3l1Q920A7 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Afg3l1Q920A7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Afg3l1Q920A7 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Afg3l1Q920A7 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Afg3l1Q920A7 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Afg3l1Q920A7 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Afg3l1Q920A7 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Afg3l1Q920A7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Afg3l1Q920A7 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Afg3l1Q920A7 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Afg3l1Q920A7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Afg3l1Q920A7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Afg3l1Q920A7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Afg3l1Q920A7 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Afg3l1Q920A7 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Afg3l1Q920A7 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Afg3l1Q920A7 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Afg3l1Q920A7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Afg3l1Q920A7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Afg3l1Q920A7 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Afg3l1Q920A7 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Afg3l1Q920A7 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Afg3l1Q920A7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Afg3l1Q920A7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Afg3l1Q920A7 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Afg3l1Q920A7 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Afg3l1Q920A7 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Afg3l1Q920A7 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Afg3l1Q920A7 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Afg3l1Q920A7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Afg3l1Q920A7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Afg3l1Q920A7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Afg3l1Q920A7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Afg3l1Q920A7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Afg3l1Q920A7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Afg3l1Q920A7 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Afg3l1Q920A7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Afg3l1Q920A7 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Afg3l1Q920A7 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Afg3l1Q920A7 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Afg3l1Q920A7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Afg3l1Q920A7 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Afg3l1Q920A7 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Afg3l1Q920A7 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Afg3l1Q920A7 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Afg3l1Q920A7 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Afg3l1Q920A7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Afg3l1Q920A7 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Afg3l1Q920A7 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Afg3l1Q920A7 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Afg3l1Q920A7 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Afg3l1Q920A7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Afg3l1Q920A7 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Afg3l1Q920A7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Afg3l1Q920A7 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Afg3l1Q920A7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Afg3l1Q920A7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Afg3l1Q920A7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Afg3l1Q920A7 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Afg3l1Q920A7 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Afg3l1Q920A7 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Afg3l1Q920A7 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Afg3l1Q920A7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Afg3l1Q920A7 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Afg3l1Q920A7 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Afg3l1Q920A7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Afg3l1Q920A7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Afg3l1Q920A7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Afg3l1Q920A7 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Afg3l1Q920A7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Afg3l1Q920A7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Afg3l1Q920A7 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 144.7 ms