Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZU9

Grin3b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin3bQ91ZU9 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25,48■■□□□ 1,67
Grin3bQ91ZU9 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25,48■■□□□ 1,67
Grin3bQ91ZU9 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,48■■□□□ 1,67
Grin3bQ91ZU9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,48■■□□□ 1,67
Grin3bQ91ZU9 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,48■■□□□ 1,67
Grin3bQ91ZU9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25,47■■□□□ 1,67
Grin3bQ91ZU9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,47■■□□□ 1,67
Grin3bQ91ZU9 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25,46■■□□□ 1,67
Grin3bQ91ZU9 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,46■■□□□ 1,67
Grin3bQ91ZU9 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25,45■■□□□ 1,66
Grin3bQ91ZU9 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,45■■□□□ 1,66
Grin3bQ91ZU9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25,45■■□□□ 1,66
Grin3bQ91ZU9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,44■■□□□ 1,66
Grin3bQ91ZU9 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,44■■□□□ 1,66
Grin3bQ91ZU9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,44■■□□□ 1,66
Grin3bQ91ZU9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,44■■□□□ 1,66
Grin3bQ91ZU9 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,44■■□□□ 1,66
Grin3bQ91ZU9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,44■■□□□ 1,66
Grin3bQ91ZU9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
Grin3bQ91ZU9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
Grin3bQ91ZU9 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
Grin3bQ91ZU9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
Grin3bQ91ZU9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
Grin3bQ91ZU9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25,42■■□□□ 1,66
Grin3bQ91ZU9 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25,42■■□□□ 1,66
Grin3bQ91ZU9 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25,42■■□□□ 1,66
Grin3bQ91ZU9 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25,42■■□□□ 1,66
Grin3bQ91ZU9 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25,42■■□□□ 1,66
Grin3bQ91ZU9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,41■■□□□ 1,66
Grin3bQ91ZU9 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25,41■■□□□ 1,66
Grin3bQ91ZU9 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,41■■□□□ 1,66
Grin3bQ91ZU9 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25,41■■□□□ 1,66
Grin3bQ91ZU9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,4■■□□□ 1,66
Grin3bQ91ZU9 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25,4■■□□□ 1,66
Grin3bQ91ZU9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,4■■□□□ 1,66
Grin3bQ91ZU9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25,4■■□□□ 1,66
Grin3bQ91ZU9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,4■■□□□ 1,66
Grin3bQ91ZU9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,4■■□□□ 1,66
Grin3bQ91ZU9 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,39■■□□□ 1,66
Grin3bQ91ZU9 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25,39■■□□□ 1,66
Grin3bQ91ZU9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25,39■■□□□ 1,65
Grin3bQ91ZU9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25,39■■□□□ 1,65
Grin3bQ91ZU9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,38■■□□□ 1,65
Grin3bQ91ZU9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25,38■■□□□ 1,65
Grin3bQ91ZU9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,37■■□□□ 1,65
Grin3bQ91ZU9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25,37■■□□□ 1,65
Grin3bQ91ZU9 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,37■■□□□ 1,65
Grin3bQ91ZU9 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,37■■□□□ 1,65
Grin3bQ91ZU9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,37■■□□□ 1,65
Grin3bQ91ZU9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,37■■□□□ 1,65
Grin3bQ91ZU9 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25,36■■□□□ 1,65
Grin3bQ91ZU9 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,36■■□□□ 1,65
Grin3bQ91ZU9 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25,35■■□□□ 1,65
Grin3bQ91ZU9 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,34■■□□□ 1,65
Grin3bQ91ZU9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,34■■□□□ 1,65
Grin3bQ91ZU9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,33■■□□□ 1,65
Grin3bQ91ZU9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,33■■□□□ 1,65
Grin3bQ91ZU9 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,33■■□□□ 1,65
Grin3bQ91ZU9 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,33■■□□□ 1,65
Grin3bQ91ZU9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25,32■■□□□ 1,64
Grin3bQ91ZU9 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,32■■□□□ 1,64
Grin3bQ91ZU9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,32■■□□□ 1,64
Grin3bQ91ZU9 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,32■■□□□ 1,64
Grin3bQ91ZU9 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25,32■■□□□ 1,64
Grin3bQ91ZU9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,32■■□□□ 1,64
Grin3bQ91ZU9 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25,31■■□□□ 1,64
Grin3bQ91ZU9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25,31■■□□□ 1,64
Grin3bQ91ZU9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,31■■□□□ 1,64
Grin3bQ91ZU9 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25,31■■□□□ 1,64
Grin3bQ91ZU9 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,31■■□□□ 1,64
Grin3bQ91ZU9 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,31■■□□□ 1,64
Grin3bQ91ZU9 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,31■■□□□ 1,64
Grin3bQ91ZU9 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25,31■■□□□ 1,64
Grin3bQ91ZU9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,3■■□□□ 1,64
Grin3bQ91ZU9 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,3■■□□□ 1,64
Grin3bQ91ZU9 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,3■■□□□ 1,64
Grin3bQ91ZU9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,3■■□□□ 1,64
Grin3bQ91ZU9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25,3■■□□□ 1,64
Grin3bQ91ZU9 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,29■■□□□ 1,64
Grin3bQ91ZU9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,29■■□□□ 1,64
Grin3bQ91ZU9 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,28■■□□□ 1,64
Grin3bQ91ZU9 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,27■■□□□ 1,64
Grin3bQ91ZU9 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,27■■□□□ 1,64
Grin3bQ91ZU9 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25,27■■□□□ 1,64
Grin3bQ91ZU9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25,26■■□□□ 1,63
Grin3bQ91ZU9 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25,26■■□□□ 1,63
Grin3bQ91ZU9 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,26■■□□□ 1,63
Grin3bQ91ZU9 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,26■■□□□ 1,63
Grin3bQ91ZU9 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25,26■■□□□ 1,63
Grin3bQ91ZU9 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25,26■■□□□ 1,63
Grin3bQ91ZU9 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,26■■□□□ 1,63
Grin3bQ91ZU9 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25,26■■□□□ 1,63
Grin3bQ91ZU9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,26■■□□□ 1,63
Grin3bQ91ZU9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,25■■□□□ 1,63
Grin3bQ91ZU9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,25■■□□□ 1,63
Grin3bQ91ZU9 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25,25■■□□□ 1,63
Grin3bQ91ZU9 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,25■■□□□ 1,63
Grin3bQ91ZU9 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25,25■■□□□ 1,63
Grin3bQ91ZU9 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25,24■■□□□ 1,63
Grin3bQ91ZU9 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,24■■□□□ 1,63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms