Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ1

Pde6c, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', mousemouse

Predictions only

Length 861 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6cQ91ZQ1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pde6cQ91ZQ1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pde6cQ91ZQ1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pde6cQ91ZQ1 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pde6cQ91ZQ1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pde6cQ91ZQ1 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pde6cQ91ZQ1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pde6cQ91ZQ1 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pde6cQ91ZQ1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pde6cQ91ZQ1 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Pde6cQ91ZQ1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pde6cQ91ZQ1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pde6cQ91ZQ1 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Pde6cQ91ZQ1 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pde6cQ91ZQ1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pde6cQ91ZQ1 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pde6cQ91ZQ1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pde6cQ91ZQ1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pde6cQ91ZQ1 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Pde6cQ91ZQ1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pde6cQ91ZQ1 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pde6cQ91ZQ1 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pde6cQ91ZQ1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pde6cQ91ZQ1 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pde6cQ91ZQ1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pde6cQ91ZQ1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pde6cQ91ZQ1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pde6cQ91ZQ1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pde6cQ91ZQ1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Pde6cQ91ZQ1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pde6cQ91ZQ1 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pde6cQ91ZQ1 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pde6cQ91ZQ1 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pde6cQ91ZQ1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pde6cQ91ZQ1 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pde6cQ91ZQ1 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pde6cQ91ZQ1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pde6cQ91ZQ1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pde6cQ91ZQ1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Pde6cQ91ZQ1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pde6cQ91ZQ1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pde6cQ91ZQ1 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pde6cQ91ZQ1 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pde6cQ91ZQ1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pde6cQ91ZQ1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pde6cQ91ZQ1 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pde6cQ91ZQ1 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pde6cQ91ZQ1 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pde6cQ91ZQ1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pde6cQ91ZQ1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pde6cQ91ZQ1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pde6cQ91ZQ1 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pde6cQ91ZQ1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pde6cQ91ZQ1 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pde6cQ91ZQ1 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Pde6cQ91ZQ1 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Pde6cQ91ZQ1 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pde6cQ91ZQ1 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pde6cQ91ZQ1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pde6cQ91ZQ1 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pde6cQ91ZQ1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pde6cQ91ZQ1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pde6cQ91ZQ1 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Pde6cQ91ZQ1 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pde6cQ91ZQ1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pde6cQ91ZQ1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Pde6cQ91ZQ1 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pde6cQ91ZQ1 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Pde6cQ91ZQ1 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Pde6cQ91ZQ1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pde6cQ91ZQ1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pde6cQ91ZQ1 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pde6cQ91ZQ1 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pde6cQ91ZQ1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pde6cQ91ZQ1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pde6cQ91ZQ1 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pde6cQ91ZQ1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pde6cQ91ZQ1 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pde6cQ91ZQ1 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Pde6cQ91ZQ1 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pde6cQ91ZQ1 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pde6cQ91ZQ1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pde6cQ91ZQ1 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pde6cQ91ZQ1 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pde6cQ91ZQ1 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pde6cQ91ZQ1 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pde6cQ91ZQ1 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pde6cQ91ZQ1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pde6cQ91ZQ1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Pde6cQ91ZQ1 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pde6cQ91ZQ1 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pde6cQ91ZQ1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pde6cQ91ZQ1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Pde6cQ91ZQ1 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pde6cQ91ZQ1 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pde6cQ91ZQ1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pde6cQ91ZQ1 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pde6cQ91ZQ1 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pde6cQ91ZQ1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pde6cQ91ZQ1 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms