Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZD4

Vangl2, Vang-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vangl2Q91ZD4 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vangl2Q91ZD4 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vangl2Q91ZD4 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vangl2Q91ZD4 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vangl2Q91ZD4 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vangl2Q91ZD4 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vangl2Q91ZD4 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vangl2Q91ZD4 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vangl2Q91ZD4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vangl2Q91ZD4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vangl2Q91ZD4 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vangl2Q91ZD4 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Vangl2Q91ZD4 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vangl2Q91ZD4 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vangl2Q91ZD4 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vangl2Q91ZD4 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vangl2Q91ZD4 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vangl2Q91ZD4 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vangl2Q91ZD4 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vangl2Q91ZD4 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vangl2Q91ZD4 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vangl2Q91ZD4 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Vangl2Q91ZD4 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vangl2Q91ZD4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vangl2Q91ZD4 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vangl2Q91ZD4 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Vangl2Q91ZD4 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Vangl2Q91ZD4 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Vangl2Q91ZD4 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Vangl2Q91ZD4 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vangl2Q91ZD4 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vangl2Q91ZD4 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vangl2Q91ZD4 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vangl2Q91ZD4 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vangl2Q91ZD4 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vangl2Q91ZD4 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vangl2Q91ZD4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vangl2Q91ZD4 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Vangl2Q91ZD4 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Vangl2Q91ZD4 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vangl2Q91ZD4 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vangl2Q91ZD4 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vangl2Q91ZD4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vangl2Q91ZD4 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Vangl2Q91ZD4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vangl2Q91ZD4 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vangl2Q91ZD4 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vangl2Q91ZD4 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vangl2Q91ZD4 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vangl2Q91ZD4 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Vangl2Q91ZD4 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vangl2Q91ZD4 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vangl2Q91ZD4 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vangl2Q91ZD4 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vangl2Q91ZD4 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Vangl2Q91ZD4 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vangl2Q91ZD4 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vangl2Q91ZD4 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vangl2Q91ZD4 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vangl2Q91ZD4 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vangl2Q91ZD4 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vangl2Q91ZD4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vangl2Q91ZD4 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vangl2Q91ZD4 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vangl2Q91ZD4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vangl2Q91ZD4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vangl2Q91ZD4 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vangl2Q91ZD4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vangl2Q91ZD4 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vangl2Q91ZD4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vangl2Q91ZD4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vangl2Q91ZD4 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vangl2Q91ZD4 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vangl2Q91ZD4 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vangl2Q91ZD4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vangl2Q91ZD4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vangl2Q91ZD4 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vangl2Q91ZD4 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vangl2Q91ZD4 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vangl2Q91ZD4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vangl2Q91ZD4 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vangl2Q91ZD4 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vangl2Q91ZD4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vangl2Q91ZD4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vangl2Q91ZD4 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vangl2Q91ZD4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vangl2Q91ZD4 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vangl2Q91ZD4 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vangl2Q91ZD4 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vangl2Q91ZD4 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vangl2Q91ZD4 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vangl2Q91ZD4 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vangl2Q91ZD4 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vangl2Q91ZD4 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vangl2Q91ZD4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vangl2Q91ZD4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vangl2Q91ZD4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vangl2Q91ZD4 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vangl2Q91ZD4 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vangl2Q91ZD4 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms