Protein–RNA interactions for Protein: Q91Y17

Pcdha2, Protocadherin alpha 2, mousemouse

Predictions only

Length 948 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdha2Q91Y17 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pcdha2Q91Y17 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pcdha2Q91Y17 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pcdha2Q91Y17 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pcdha2Q91Y17 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pcdha2Q91Y17 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pcdha2Q91Y17 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pcdha2Q91Y17 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pcdha2Q91Y17 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pcdha2Q91Y17 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pcdha2Q91Y17 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Pcdha2Q91Y17 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pcdha2Q91Y17 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pcdha2Q91Y17 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pcdha2Q91Y17 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pcdha2Q91Y17 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pcdha2Q91Y17 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pcdha2Q91Y17 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pcdha2Q91Y17 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pcdha2Q91Y17 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pcdha2Q91Y17 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Pcdha2Q91Y17 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pcdha2Q91Y17 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pcdha2Q91Y17 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pcdha2Q91Y17 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pcdha2Q91Y17 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pcdha2Q91Y17 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Pcdha2Q91Y17 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pcdha2Q91Y17 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Pcdha2Q91Y17 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pcdha2Q91Y17 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pcdha2Q91Y17 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pcdha2Q91Y17 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pcdha2Q91Y17 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pcdha2Q91Y17 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pcdha2Q91Y17 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pcdha2Q91Y17 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pcdha2Q91Y17 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pcdha2Q91Y17 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pcdha2Q91Y17 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pcdha2Q91Y17 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pcdha2Q91Y17 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pcdha2Q91Y17 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pcdha2Q91Y17 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pcdha2Q91Y17 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Pcdha2Q91Y17 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pcdha2Q91Y17 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pcdha2Q91Y17 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pcdha2Q91Y17 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pcdha2Q91Y17 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pcdha2Q91Y17 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pcdha2Q91Y17 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pcdha2Q91Y17 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pcdha2Q91Y17 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pcdha2Q91Y17 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pcdha2Q91Y17 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pcdha2Q91Y17 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pcdha2Q91Y17 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pcdha2Q91Y17 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pcdha2Q91Y17 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pcdha2Q91Y17 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pcdha2Q91Y17 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pcdha2Q91Y17 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pcdha2Q91Y17 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pcdha2Q91Y17 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pcdha2Q91Y17 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pcdha2Q91Y17 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pcdha2Q91Y17 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pcdha2Q91Y17 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pcdha2Q91Y17 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pcdha2Q91Y17 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pcdha2Q91Y17 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pcdha2Q91Y17 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Pcdha2Q91Y17 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pcdha2Q91Y17 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pcdha2Q91Y17 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pcdha2Q91Y17 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pcdha2Q91Y17 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pcdha2Q91Y17 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pcdha2Q91Y17 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pcdha2Q91Y17 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Pcdha2Q91Y17 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pcdha2Q91Y17 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pcdha2Q91Y17 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pcdha2Q91Y17 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pcdha2Q91Y17 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pcdha2Q91Y17 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pcdha2Q91Y17 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pcdha2Q91Y17 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pcdha2Q91Y17 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Pcdha2Q91Y17 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pcdha2Q91Y17 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pcdha2Q91Y17 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Pcdha2Q91Y17 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pcdha2Q91Y17 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pcdha2Q91Y17 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pcdha2Q91Y17 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pcdha2Q91Y17 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pcdha2Q91Y17 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pcdha2Q91Y17 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.6 ms