Protein–RNA interactions for Protein: Q91WS2

Nlrp6, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 869 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp6Q91WS2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Nlrp6Q91WS2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Nlrp6Q91WS2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Nlrp6Q91WS2 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Nlrp6Q91WS2 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
Nlrp6Q91WS2 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Nlrp6Q91WS2 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Nlrp6Q91WS2 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Nlrp6Q91WS2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Nlrp6Q91WS2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Nlrp6Q91WS2 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Nlrp6Q91WS2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Nlrp6Q91WS2 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Nlrp6Q91WS2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Nlrp6Q91WS2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Nlrp6Q91WS2 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Nlrp6Q91WS2 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
Nlrp6Q91WS2 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Nlrp6Q91WS2 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
Nlrp6Q91WS2 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Nlrp6Q91WS2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Nlrp6Q91WS2 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Nlrp6Q91WS2 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Nlrp6Q91WS2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Nlrp6Q91WS2 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Nlrp6Q91WS2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Nlrp6Q91WS2 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Nlrp6Q91WS2 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Nlrp6Q91WS2 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
Nlrp6Q91WS2 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Nlrp6Q91WS2 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
Nlrp6Q91WS2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Nlrp6Q91WS2 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Nlrp6Q91WS2 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Nlrp6Q91WS2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Nlrp6Q91WS2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Nlrp6Q91WS2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Nlrp6Q91WS2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Nlrp6Q91WS2 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Nlrp6Q91WS2 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Nlrp6Q91WS2 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Nlrp6Q91WS2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Nlrp6Q91WS2 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Nlrp6Q91WS2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Nlrp6Q91WS2 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Nlrp6Q91WS2 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Nlrp6Q91WS2 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC30.35■■■□□ 2.45
Nlrp6Q91WS2 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Nlrp6Q91WS2 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Nlrp6Q91WS2 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Nlrp6Q91WS2 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Nlrp6Q91WS2 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Nlrp6Q91WS2 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Nlrp6Q91WS2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Nlrp6Q91WS2 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
Nlrp6Q91WS2 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Nlrp6Q91WS2 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
Nlrp6Q91WS2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Nlrp6Q91WS2 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
Nlrp6Q91WS2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Nlrp6Q91WS2 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Nlrp6Q91WS2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Nlrp6Q91WS2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Nlrp6Q91WS2 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Nlrp6Q91WS2 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Nlrp6Q91WS2 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Nlrp6Q91WS2 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Nlrp6Q91WS2 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Nlrp6Q91WS2 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Nlrp6Q91WS2 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Nlrp6Q91WS2 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Nlrp6Q91WS2 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Nlrp6Q91WS2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Nlrp6Q91WS2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Nlrp6Q91WS2 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Nlrp6Q91WS2 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Nlrp6Q91WS2 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Nlrp6Q91WS2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Nlrp6Q91WS2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Nlrp6Q91WS2 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
Nlrp6Q91WS2 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
Nlrp6Q91WS2 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Nlrp6Q91WS2 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Nlrp6Q91WS2 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Nlrp6Q91WS2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Nlrp6Q91WS2 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Nlrp6Q91WS2 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Nlrp6Q91WS2 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Nlrp6Q91WS2 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Nlrp6Q91WS2 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Nlrp6Q91WS2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Nlrp6Q91WS2 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Nlrp6Q91WS2 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Nlrp6Q91WS2 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Nlrp6Q91WS2 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Nlrp6Q91WS2 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Nlrp6Q91WS2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Nlrp6Q91WS2 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Nlrp6Q91WS2 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Nlrp6Q91WS2 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms