Protein–RNA interactions for Protein: Q91V80

Apof, Apolipoprotein F, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApofQ91V80 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ApofQ91V80 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ApofQ91V80 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ApofQ91V80 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ApofQ91V80 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ApofQ91V80 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ApofQ91V80 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ApofQ91V80 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ApofQ91V80 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ApofQ91V80 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ApofQ91V80 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ApofQ91V80 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ApofQ91V80 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ApofQ91V80 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ApofQ91V80 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ApofQ91V80 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ApofQ91V80 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ApofQ91V80 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ApofQ91V80 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ApofQ91V80 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ApofQ91V80 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ApofQ91V80 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ApofQ91V80 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ApofQ91V80 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ApofQ91V80 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ApofQ91V80 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ApofQ91V80 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ApofQ91V80 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ApofQ91V80 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ApofQ91V80 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ApofQ91V80 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ApofQ91V80 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ApofQ91V80 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ApofQ91V80 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ApofQ91V80 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ApofQ91V80 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ApofQ91V80 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ApofQ91V80 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ApofQ91V80 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ApofQ91V80 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ApofQ91V80 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ApofQ91V80 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ApofQ91V80 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ApofQ91V80 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ApofQ91V80 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ApofQ91V80 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ApofQ91V80 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ApofQ91V80 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ApofQ91V80 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ApofQ91V80 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ApofQ91V80 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ApofQ91V80 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ApofQ91V80 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ApofQ91V80 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ApofQ91V80 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ApofQ91V80 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ApofQ91V80 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ApofQ91V80 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ApofQ91V80 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ApofQ91V80 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ApofQ91V80 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ApofQ91V80 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ApofQ91V80 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ApofQ91V80 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ApofQ91V80 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ApofQ91V80 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ApofQ91V80 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ApofQ91V80 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ApofQ91V80 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ApofQ91V80 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ApofQ91V80 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ApofQ91V80 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ApofQ91V80 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ApofQ91V80 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ApofQ91V80 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ApofQ91V80 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ApofQ91V80 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ApofQ91V80 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ApofQ91V80 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ApofQ91V80 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ApofQ91V80 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ApofQ91V80 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ApofQ91V80 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ApofQ91V80 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ApofQ91V80 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ApofQ91V80 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ApofQ91V80 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ApofQ91V80 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ApofQ91V80 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ApofQ91V80 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ApofQ91V80 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ApofQ91V80 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ApofQ91V80 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ApofQ91V80 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ApofQ91V80 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ApofQ91V80 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ApofQ91V80 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ApofQ91V80 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ApofQ91V80 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ApofQ91V80 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms