Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCD7

Kdm4c, Lysine-specific demethylase 4C, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4cQ8VCD7 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Kdm4cQ8VCD7 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Kdm4cQ8VCD7 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Kdm4cQ8VCD7 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Kdm4cQ8VCD7 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Kdm4cQ8VCD7 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Kdm4cQ8VCD7 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Kdm4cQ8VCD7 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Kdm4cQ8VCD7 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Kdm4cQ8VCD7 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Kdm4cQ8VCD7 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Kdm4cQ8VCD7 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Kdm4cQ8VCD7 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Kdm4cQ8VCD7 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Kdm4cQ8VCD7 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Kdm4cQ8VCD7 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Kdm4cQ8VCD7 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Kdm4cQ8VCD7 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Kdm4cQ8VCD7 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Kdm4cQ8VCD7 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Kdm4cQ8VCD7 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Kdm4cQ8VCD7 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Kdm4cQ8VCD7 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Kdm4cQ8VCD7 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Kdm4cQ8VCD7 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Kdm4cQ8VCD7 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Kdm4cQ8VCD7 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Kdm4cQ8VCD7 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Kdm4cQ8VCD7 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Kdm4cQ8VCD7 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Kdm4cQ8VCD7 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Kdm4cQ8VCD7 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Kdm4cQ8VCD7 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Kdm4cQ8VCD7 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Kdm4cQ8VCD7 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Kdm4cQ8VCD7 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Kdm4cQ8VCD7 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Kdm4cQ8VCD7 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Kdm4cQ8VCD7 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Kdm4cQ8VCD7 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Kdm4cQ8VCD7 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Kdm4cQ8VCD7 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Kdm4cQ8VCD7 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Kdm4cQ8VCD7 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Kdm4cQ8VCD7 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Kdm4cQ8VCD7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Kdm4cQ8VCD7 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Kdm4cQ8VCD7 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Kdm4cQ8VCD7 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Kdm4cQ8VCD7 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Kdm4cQ8VCD7 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Kdm4cQ8VCD7 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Kdm4cQ8VCD7 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Kdm4cQ8VCD7 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Kdm4cQ8VCD7 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Kdm4cQ8VCD7 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Kdm4cQ8VCD7 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Kdm4cQ8VCD7 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Kdm4cQ8VCD7 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Kdm4cQ8VCD7 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Kdm4cQ8VCD7 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Kdm4cQ8VCD7 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Kdm4cQ8VCD7 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Kdm4cQ8VCD7 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Kdm4cQ8VCD7 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Kdm4cQ8VCD7 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Kdm4cQ8VCD7 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Kdm4cQ8VCD7 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Kdm4cQ8VCD7 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Kdm4cQ8VCD7 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Kdm4cQ8VCD7 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Kdm4cQ8VCD7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Kdm4cQ8VCD7 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Kdm4cQ8VCD7 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Kdm4cQ8VCD7 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Kdm4cQ8VCD7 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.88
Kdm4cQ8VCD7 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Kdm4cQ8VCD7 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Kdm4cQ8VCD7 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Kdm4cQ8VCD7 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Kdm4cQ8VCD7 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Kdm4cQ8VCD7 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Kdm4cQ8VCD7 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Kdm4cQ8VCD7 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Kdm4cQ8VCD7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Kdm4cQ8VCD7 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Kdm4cQ8VCD7 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Kdm4cQ8VCD7 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Kdm4cQ8VCD7 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Kdm4cQ8VCD7 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Kdm4cQ8VCD7 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Kdm4cQ8VCD7 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Kdm4cQ8VCD7 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Kdm4cQ8VCD7 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Kdm4cQ8VCD7 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Kdm4cQ8VCD7 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Kdm4cQ8VCD7 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Kdm4cQ8VCD7 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Kdm4cQ8VCD7 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Kdm4cQ8VCD7 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms